Protein–RNA interactions for Protein: Q13616

CUL1, Cullin-1, humanhuman

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Length 776 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CUL1Q13616 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CUL1Q13616 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CUL1Q13616 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CUL1Q13616 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CUL1Q13616 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CUL1Q13616 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CUL1Q13616 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CUL1Q13616 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CUL1Q13616 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CUL1Q13616 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CUL1Q13616 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CUL1Q13616 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CUL1Q13616 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CUL1Q13616 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CUL1Q13616 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CUL1Q13616 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CUL1Q13616 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CUL1Q13616 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
CUL1Q13616 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CUL1Q13616 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CUL1Q13616 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
CUL1Q13616 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CUL1Q13616 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CUL1Q13616 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CUL1Q13616 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CUL1Q13616 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CUL1Q13616 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
CUL1Q13616 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CUL1Q13616 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CUL1Q13616 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CUL1Q13616 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CUL1Q13616 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CUL1Q13616 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
CUL1Q13616 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CUL1Q13616 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CUL1Q13616 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
CUL1Q13616 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CUL1Q13616 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CUL1Q13616 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CUL1Q13616 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CUL1Q13616 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CUL1Q13616 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CUL1Q13616 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CUL1Q13616 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CUL1Q13616 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CUL1Q13616 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CUL1Q13616 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CUL1Q13616 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CUL1Q13616 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CUL1Q13616 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CUL1Q13616 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CUL1Q13616 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CUL1Q13616 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CUL1Q13616 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CUL1Q13616 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CUL1Q13616 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CUL1Q13616 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CUL1Q13616 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
CUL1Q13616 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CUL1Q13616 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CUL1Q13616 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CUL1Q13616 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CUL1Q13616 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CUL1Q13616 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CUL1Q13616 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CUL1Q13616 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CUL1Q13616 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
CUL1Q13616 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
CUL1Q13616 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
CUL1Q13616 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
CUL1Q13616 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CUL1Q13616 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CUL1Q13616 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CUL1Q13616 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CUL1Q13616 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CUL1Q13616 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CUL1Q13616 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CUL1Q13616 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CUL1Q13616 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CUL1Q13616 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CUL1Q13616 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CUL1Q13616 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CUL1Q13616 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CUL1Q13616 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CUL1Q13616 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CUL1Q13616 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CUL1Q13616 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CUL1Q13616 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CUL1Q13616 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
CUL1Q13616 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CUL1Q13616 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CUL1Q13616 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CUL1Q13616 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CUL1Q13616 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CUL1Q13616 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CUL1Q13616 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CUL1Q13616 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CUL1Q13616 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CUL1Q13616 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CUL1Q13616 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
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