Protein–RNA interactions for Protein: Q13562

NEUROD1, Neurogenic differentiation factor 1, humanhuman

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Length 356 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEUROD1Q13562 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.26■■■□□ 2.75
NEUROD1Q13562 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.25■■■□□ 2.75
NEUROD1Q13562 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC32.25■■■□□ 2.75
NEUROD1Q13562 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.25■■■□□ 2.75
NEUROD1Q13562 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC32.25■■■□□ 2.75
NEUROD1Q13562 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.25■■■□□ 2.75
NEUROD1Q13562 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC32.25■■■□□ 2.75
NEUROD1Q13562 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC32.25■■■□□ 2.75
NEUROD1Q13562 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC32.25■■■□□ 2.75
NEUROD1Q13562 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC32.25■■■□□ 2.75
NEUROD1Q13562 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.25■■■□□ 2.75
NEUROD1Q13562 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.25■■■□□ 2.75
NEUROD1Q13562 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.25■■■□□ 2.75
NEUROD1Q13562 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC32.24■■■□□ 2.75
NEUROD1Q13562 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.24■■■□□ 2.75
NEUROD1Q13562 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.24■■■□□ 2.75
NEUROD1Q13562 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC32.24■■■□□ 2.75
NEUROD1Q13562 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC32.24■■■□□ 2.75
NEUROD1Q13562 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.24■■■□□ 2.75
NEUROD1Q13562 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC32.24■■■□□ 2.75
NEUROD1Q13562 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.24■■■□□ 2.75
NEUROD1Q13562 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.24■■■□□ 2.75
NEUROD1Q13562 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC32.24■■■□□ 2.75
NEUROD1Q13562 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.24■■■□□ 2.75
NEUROD1Q13562 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC32.24■■■□□ 2.75
NEUROD1Q13562 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC32.24■■■□□ 2.75
NEUROD1Q13562 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.24■■■□□ 2.75
NEUROD1Q13562 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.23■■■□□ 2.75
NEUROD1Q13562 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC32.23■■■□□ 2.75
NEUROD1Q13562 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC32.23■■■□□ 2.75
NEUROD1Q13562 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.23■■■□□ 2.75
NEUROD1Q13562 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC32.23■■■□□ 2.75
NEUROD1Q13562 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.23■■■□□ 2.75
NEUROD1Q13562 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC32.23■■■□□ 2.75
NEUROD1Q13562 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC32.23■■■□□ 2.75
NEUROD1Q13562 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC32.23■■■□□ 2.75
NEUROD1Q13562 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.23■■■□□ 2.75
NEUROD1Q13562 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.23■■■□□ 2.75
NEUROD1Q13562 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC32.22■■■□□ 2.75
NEUROD1Q13562 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.22■■■□□ 2.75
NEUROD1Q13562 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC32.22■■■□□ 2.75
NEUROD1Q13562 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC32.22■■■□□ 2.75
NEUROD1Q13562 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC32.22■■■□□ 2.75
NEUROD1Q13562 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.22■■■□□ 2.75
NEUROD1Q13562 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC32.22■■■□□ 2.75
NEUROD1Q13562 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC32.22■■■□□ 2.75
NEUROD1Q13562 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.22■■■□□ 2.75
NEUROD1Q13562 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.22■■■□□ 2.75
NEUROD1Q13562 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC32.21■■■□□ 2.75
NEUROD1Q13562 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.21■■■□□ 2.75
NEUROD1Q13562 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.21■■■□□ 2.75
NEUROD1Q13562 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.21■■■□□ 2.75
NEUROD1Q13562 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.21■■■□□ 2.75
NEUROD1Q13562 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.21■■■□□ 2.75
NEUROD1Q13562 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.2■■■□□ 2.75
NEUROD1Q13562 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC32.2■■■□□ 2.75
NEUROD1Q13562 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC32.2■■■□□ 2.75
NEUROD1Q13562 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.2■■■□□ 2.75
NEUROD1Q13562 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.2■■■□□ 2.75
NEUROD1Q13562 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC32.19■■■□□ 2.74
NEUROD1Q13562 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.19■■■□□ 2.74
NEUROD1Q13562 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC32.19■■■□□ 2.74
NEUROD1Q13562 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.19■■■□□ 2.74
NEUROD1Q13562 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.19■■■□□ 2.74
NEUROD1Q13562 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.19■■■□□ 2.74
NEUROD1Q13562 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.19■■■□□ 2.74
NEUROD1Q13562 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC32.19■■■□□ 2.74
NEUROD1Q13562 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC32.18■■■□□ 2.74
NEUROD1Q13562 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.18■■■□□ 2.74
NEUROD1Q13562 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.18■■■□□ 2.74
NEUROD1Q13562 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC32.18■■■□□ 2.74
NEUROD1Q13562 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.18■■■□□ 2.74
NEUROD1Q13562 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.18■■■□□ 2.74
NEUROD1Q13562 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.18■■■□□ 2.74
NEUROD1Q13562 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC32.17■■■□□ 2.74
NEUROD1Q13562 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC32.17■■■□□ 2.74
NEUROD1Q13562 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.17■■■□□ 2.74
NEUROD1Q13562 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC32.17■■■□□ 2.74
NEUROD1Q13562 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC32.17■■■□□ 2.74
NEUROD1Q13562 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC32.17■■■□□ 2.74
NEUROD1Q13562 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.16■■■□□ 2.74
NEUROD1Q13562 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC32.16■■■□□ 2.74
NEUROD1Q13562 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC32.16■■■□□ 2.74
NEUROD1Q13562 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC32.16■■■□□ 2.74
NEUROD1Q13562 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC32.16■■■□□ 2.74
NEUROD1Q13562 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC32.16■■■□□ 2.74
NEUROD1Q13562 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC32.16■■■□□ 2.74
NEUROD1Q13562 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC32.16■■■□□ 2.74
NEUROD1Q13562 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC32.16■■■□□ 2.74
NEUROD1Q13562 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.16■■■□□ 2.74
NEUROD1Q13562 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC32.16■■■□□ 2.74
NEUROD1Q13562 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.16■■■□□ 2.74
NEUROD1Q13562 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC32.15■■■□□ 2.74
NEUROD1Q13562 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC32.15■■■□□ 2.74
NEUROD1Q13562 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC32.15■■■□□ 2.74
NEUROD1Q13562 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.15■■■□□ 2.74
NEUROD1Q13562 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.15■■■□□ 2.74
NEUROD1Q13562 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.15■■■□□ 2.74
NEUROD1Q13562 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC32.14■■■□□ 2.74
NEUROD1Q13562 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.14■■■□□ 2.74
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