Protein–RNA interactions for Protein: Q13515

BFSP2, Phakinin, humanhuman

Predictions only

Length 415 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BFSP2Q13515 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
BFSP2Q13515 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
BFSP2Q13515 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
BFSP2Q13515 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC24.13■■□□□ 1.45
BFSP2Q13515 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
BFSP2Q13515 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
BFSP2Q13515 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC24.13■■□□□ 1.45
BFSP2Q13515 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
BFSP2Q13515 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
BFSP2Q13515 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
BFSP2Q13515 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
BFSP2Q13515 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
BFSP2Q13515 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC24.12■■□□□ 1.45
BFSP2Q13515 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
BFSP2Q13515 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
BFSP2Q13515 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
BFSP2Q13515 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
BFSP2Q13515 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
BFSP2Q13515 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
BFSP2Q13515 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
BFSP2Q13515 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
BFSP2Q13515 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
BFSP2Q13515 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
BFSP2Q13515 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
BFSP2Q13515 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
BFSP2Q13515 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
BFSP2Q13515 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
BFSP2Q13515 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
BFSP2Q13515 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
BFSP2Q13515 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
BFSP2Q13515 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
BFSP2Q13515 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
BFSP2Q13515 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
BFSP2Q13515 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
BFSP2Q13515 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
BFSP2Q13515 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
BFSP2Q13515 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
BFSP2Q13515 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
BFSP2Q13515 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
BFSP2Q13515 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
BFSP2Q13515 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
BFSP2Q13515 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
BFSP2Q13515 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
BFSP2Q13515 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
BFSP2Q13515 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
BFSP2Q13515 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
BFSP2Q13515 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
BFSP2Q13515 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
BFSP2Q13515 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
BFSP2Q13515 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
BFSP2Q13515 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
BFSP2Q13515 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC24.09■■□□□ 1.45
BFSP2Q13515 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
BFSP2Q13515 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
BFSP2Q13515 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
BFSP2Q13515 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
BFSP2Q13515 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
BFSP2Q13515 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
BFSP2Q13515 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
BFSP2Q13515 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
BFSP2Q13515 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
BFSP2Q13515 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
BFSP2Q13515 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
BFSP2Q13515 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
BFSP2Q13515 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
BFSP2Q13515 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
BFSP2Q13515 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
BFSP2Q13515 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
BFSP2Q13515 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
BFSP2Q13515 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
BFSP2Q13515 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
BFSP2Q13515 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
BFSP2Q13515 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
BFSP2Q13515 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
BFSP2Q13515 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
BFSP2Q13515 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
BFSP2Q13515 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
BFSP2Q13515 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
BFSP2Q13515 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
BFSP2Q13515 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
BFSP2Q13515 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
BFSP2Q13515 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
BFSP2Q13515 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
BFSP2Q13515 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
BFSP2Q13515 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
BFSP2Q13515 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
BFSP2Q13515 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC24.05■■□□□ 1.44
BFSP2Q13515 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
BFSP2Q13515 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
BFSP2Q13515 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
BFSP2Q13515 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
BFSP2Q13515 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
BFSP2Q13515 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
BFSP2Q13515 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
BFSP2Q13515 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
BFSP2Q13515 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
BFSP2Q13515 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
BFSP2Q13515 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
BFSP2Q13515 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
BFSP2Q13515 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
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