Protein–RNA interactions for Protein: Q13507

TRPC3, Short transient receptor potential channel 3, humanhuman

Predictions only

Length 836 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRPC3Q13507 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
TRPC3Q13507 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
TRPC3Q13507 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
TRPC3Q13507 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
TRPC3Q13507 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
TRPC3Q13507 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
TRPC3Q13507 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
TRPC3Q13507 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
TRPC3Q13507 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
TRPC3Q13507 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
TRPC3Q13507 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
TRPC3Q13507 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
TRPC3Q13507 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
TRPC3Q13507 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
TRPC3Q13507 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
TRPC3Q13507 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
TRPC3Q13507 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
TRPC3Q13507 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
TRPC3Q13507 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
TRPC3Q13507 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
TRPC3Q13507 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
TRPC3Q13507 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
TRPC3Q13507 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
TRPC3Q13507 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
TRPC3Q13507 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
TRPC3Q13507 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
TRPC3Q13507 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
TRPC3Q13507 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
TRPC3Q13507 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
TRPC3Q13507 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
TRPC3Q13507 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
TRPC3Q13507 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
TRPC3Q13507 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
TRPC3Q13507 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
TRPC3Q13507 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC23.61■■□□□ 1.37
TRPC3Q13507 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
TRPC3Q13507 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
TRPC3Q13507 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
TRPC3Q13507 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
TRPC3Q13507 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
TRPC3Q13507 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
TRPC3Q13507 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
TRPC3Q13507 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
TRPC3Q13507 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
TRPC3Q13507 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
TRPC3Q13507 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
TRPC3Q13507 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
TRPC3Q13507 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
TRPC3Q13507 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
TRPC3Q13507 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
TRPC3Q13507 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
TRPC3Q13507 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
TRPC3Q13507 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
TRPC3Q13507 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC23.6■■□□□ 1.37
TRPC3Q13507 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
TRPC3Q13507 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
TRPC3Q13507 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
TRPC3Q13507 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
TRPC3Q13507 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
TRPC3Q13507 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
TRPC3Q13507 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
TRPC3Q13507 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
TRPC3Q13507 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
TRPC3Q13507 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
TRPC3Q13507 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
TRPC3Q13507 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
TRPC3Q13507 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
TRPC3Q13507 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
TRPC3Q13507 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
TRPC3Q13507 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
TRPC3Q13507 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
TRPC3Q13507 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
TRPC3Q13507 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
TRPC3Q13507 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
TRPC3Q13507 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
TRPC3Q13507 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
TRPC3Q13507 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC23.59■■□□□ 1.37
TRPC3Q13507 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
TRPC3Q13507 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
TRPC3Q13507 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
TRPC3Q13507 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
TRPC3Q13507 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC23.58■■□□□ 1.37
TRPC3Q13507 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
TRPC3Q13507 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
TRPC3Q13507 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC23.58■■□□□ 1.36
TRPC3Q13507 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
TRPC3Q13507 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
TRPC3Q13507 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
TRPC3Q13507 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC23.57■■□□□ 1.36
TRPC3Q13507 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
TRPC3Q13507 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
TRPC3Q13507 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
TRPC3Q13507 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
TRPC3Q13507 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
TRPC3Q13507 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
TRPC3Q13507 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
TRPC3Q13507 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
TRPC3Q13507 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
TRPC3Q13507 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
TRPC3Q13507 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
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