Protein–RNA interactions for Protein: Q13480

GAB1, GRB2-associated-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 694 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GAB1Q13480 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
GAB1Q13480 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
GAB1Q13480 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
GAB1Q13480 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC20.71■□□□□ 0.91
GAB1Q13480 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
GAB1Q13480 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
GAB1Q13480 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
GAB1Q13480 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
GAB1Q13480 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
GAB1Q13480 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
GAB1Q13480 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC20.71■□□□□ 0.91
GAB1Q13480 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.91
GAB1Q13480 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
GAB1Q13480 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
GAB1Q13480 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
GAB1Q13480 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
GAB1Q13480 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
GAB1Q13480 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC20.7■□□□□ 0.9
GAB1Q13480 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
GAB1Q13480 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
GAB1Q13480 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
GAB1Q13480 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
GAB1Q13480 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
GAB1Q13480 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC20.69■□□□□ 0.9
GAB1Q13480 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
GAB1Q13480 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
GAB1Q13480 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
GAB1Q13480 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
GAB1Q13480 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
GAB1Q13480 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
GAB1Q13480 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
GAB1Q13480 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC20.69■□□□□ 0.9
GAB1Q13480 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
GAB1Q13480 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
GAB1Q13480 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
GAB1Q13480 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
GAB1Q13480 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
GAB1Q13480 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
GAB1Q13480 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
GAB1Q13480 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
GAB1Q13480 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
GAB1Q13480 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
GAB1Q13480 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
GAB1Q13480 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
GAB1Q13480 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
GAB1Q13480 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
GAB1Q13480 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
GAB1Q13480 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
GAB1Q13480 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
GAB1Q13480 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
GAB1Q13480 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
GAB1Q13480 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
GAB1Q13480 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
GAB1Q13480 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
GAB1Q13480 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC20.67■□□□□ 0.9
GAB1Q13480 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC20.67■□□□□ 0.9
GAB1Q13480 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
GAB1Q13480 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
GAB1Q13480 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
GAB1Q13480 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
GAB1Q13480 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
GAB1Q13480 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
GAB1Q13480 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
GAB1Q13480 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
GAB1Q13480 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
GAB1Q13480 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
GAB1Q13480 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
GAB1Q13480 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
GAB1Q13480 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
GAB1Q13480 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
GAB1Q13480 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
GAB1Q13480 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC20.66■□□□□ 0.9
GAB1Q13480 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
GAB1Q13480 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
GAB1Q13480 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
GAB1Q13480 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
GAB1Q13480 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
GAB1Q13480 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
GAB1Q13480 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC20.65■□□□□ 0.9
GAB1Q13480 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC20.65■□□□□ 0.9
GAB1Q13480 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
GAB1Q13480 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
GAB1Q13480 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
GAB1Q13480 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
GAB1Q13480 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
GAB1Q13480 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
GAB1Q13480 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
GAB1Q13480 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
GAB1Q13480 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
GAB1Q13480 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
GAB1Q13480 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
GAB1Q13480 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
GAB1Q13480 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
GAB1Q13480 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.64■□□□□ 0.89
GAB1Q13480 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
GAB1Q13480 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC20.64■□□□□ 0.89
GAB1Q13480 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
GAB1Q13480 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
GAB1Q13480 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
GAB1Q13480 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.6 ms