Protein–RNA interactions for Protein: Q13404

UBE2V1, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 variant 1, humanhuman

Predictions only

Length 147 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE2V1Q13404 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
UBE2V1Q13404 SLMAP-201ENST00000295951 5433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
UBE2V1Q13404 AGFG2-201ENST00000300176 4796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
UBE2V1Q13404 GOLGA3-203ENST00000456883 5496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
UBE2V1Q13404 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
UBE2V1Q13404 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
UBE2V1Q13404 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
UBE2V1Q13404 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
UBE2V1Q13404 PPM1B-201ENST00000282412 2606 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
UBE2V1Q13404 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
UBE2V1Q13404 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
UBE2V1Q13404 ISLR2-210ENST00000565540 2780 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.32■□□□□ 0.04
UBE2V1Q13404 TDRKH-203ENST00000368824 2824 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
UBE2V1Q13404 ASCC2-202ENST00000397771 2823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
UBE2V1Q13404 ATRN-201ENST00000262919 8633 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
UBE2V1Q13404 UBE2QL1-201ENST00000399816 4317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
UBE2V1Q13404 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
UBE2V1Q13404 FIP1L1-203ENST00000358575 2180 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
UBE2V1Q13404 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
UBE2V1Q13404 AR-207ENST00000612010 3896 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
UBE2V1Q13404 EI24-201ENST00000278903 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
UBE2V1Q13404 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
UBE2V1Q13404 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
UBE2V1Q13404 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
UBE2V1Q13404 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
UBE2V1Q13404 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
UBE2V1Q13404 EIF4ENIF1-202ENST00000344710 3115 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
UBE2V1Q13404 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
UBE2V1Q13404 IMPDH1-214ENST00000496200 2283 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
UBE2V1Q13404 BMP1-202ENST00000306385 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
UBE2V1Q13404 SOCS2-212ENST00000622746 2881 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
UBE2V1Q13404 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
UBE2V1Q13404 IRS2-201ENST00000375856 8138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
UBE2V1Q13404 SPTBN4-204ENST00000392025 8671 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
UBE2V1Q13404 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
UBE2V1Q13404 IQSEC2-218ENST00000640694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
UBE2V1Q13404 SPTBN4-207ENST00000595535 6105 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
UBE2V1Q13404 RTN4-201ENST00000317610 2333 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
UBE2V1Q13404 ZNF74-202ENST00000400451 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
UBE2V1Q13404 SULF2-201ENST00000359930 4915 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
UBE2V1Q13404 LONP1-201ENST00000360614 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
UBE2V1Q13404 RHOU-201ENST00000366691 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
UBE2V1Q13404 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
UBE2V1Q13404 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
UBE2V1Q13404 MXD3-202ENST00000427908 2269 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
UBE2V1Q13404 B3GNT9-201ENST00000449549 2917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
UBE2V1Q13404 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
UBE2V1Q13404 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
UBE2V1Q13404 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
UBE2V1Q13404 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
UBE2V1Q13404 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
UBE2V1Q13404 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
UBE2V1Q13404 DHRS7-201ENST00000216500 2322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
UBE2V1Q13404 QKI-201ENST00000275262 6964 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
UBE2V1Q13404 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
UBE2V1Q13404 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
UBE2V1Q13404 AL691447.2-201ENST00000454869 2162 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
UBE2V1Q13404 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
UBE2V1Q13404 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
UBE2V1Q13404 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
UBE2V1Q13404 KCNQ5-207ENST00000403813 6539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
UBE2V1Q13404 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
UBE2V1Q13404 CDCA7L-203ENST00000406877 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
UBE2V1Q13404 MYH14-208ENST00000598205 6137 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
UBE2V1Q13404 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
UBE2V1Q13404 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
UBE2V1Q13404 WT1-205ENST00000452863 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
UBE2V1Q13404 SHC3-202ENST00000375835 9768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
UBE2V1Q13404 ST3GAL3-206ENST00000351035 2377 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
UBE2V1Q13404 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
UBE2V1Q13404 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
UBE2V1Q13404 SMC4-201ENST00000344722 5356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
UBE2V1Q13404 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
UBE2V1Q13404 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
UBE2V1Q13404 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
UBE2V1Q13404 FGFR2-204ENST00000356226 3547 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
UBE2V1Q13404 STK11-201ENST00000326873 2611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
UBE2V1Q13404 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
UBE2V1Q13404 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
UBE2V1Q13404 MCCC1-214ENST00000610757 2410 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
UBE2V1Q13404 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
UBE2V1Q13404 KCNC4-204ENST00000438661 2953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
UBE2V1Q13404 SCRIB-201ENST00000320476 5143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
UBE2V1Q13404 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
UBE2V1Q13404 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
UBE2V1Q13404 NOS1AP-206ENST00000530878 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
UBE2V1Q13404 ANKRD40-201ENST00000285243 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
UBE2V1Q13404 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
UBE2V1Q13404 GOLPH3-201ENST00000265070 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
UBE2V1Q13404 RAPH1-211ENST00000457812 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
UBE2V1Q13404 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
UBE2V1Q13404 GLDN-201ENST00000335449 4971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
UBE2V1Q13404 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
UBE2V1Q13404 ARMC6-202ENST00000392335 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
UBE2V1Q13404 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
UBE2V1Q13404 PPP3CA-203ENST00000394854 4685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
UBE2V1Q13404 SORCS2-203ENST00000507866 6152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
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UBE2V1Q13404 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
UBE2V1Q13404 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
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