Protein–RNA interactions for Protein: Q13401

PMS2P3, Putative postmeiotic segregation increased 2-like protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 168 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PMS2P3Q13401 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
PMS2P3Q13401 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
PMS2P3Q13401 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
PMS2P3Q13401 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
PMS2P3Q13401 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
PMS2P3Q13401 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
PMS2P3Q13401 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
PMS2P3Q13401 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
PMS2P3Q13401 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
PMS2P3Q13401 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
PMS2P3Q13401 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
PMS2P3Q13401 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
PMS2P3Q13401 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
PMS2P3Q13401 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
PMS2P3Q13401 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
PMS2P3Q13401 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
PMS2P3Q13401 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
PMS2P3Q13401 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
PMS2P3Q13401 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
PMS2P3Q13401 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
PMS2P3Q13401 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
PMS2P3Q13401 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
PMS2P3Q13401 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
PMS2P3Q13401 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
PMS2P3Q13401 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
PMS2P3Q13401 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
PMS2P3Q13401 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC20.4■□□□□ 0.86
PMS2P3Q13401 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
PMS2P3Q13401 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
PMS2P3Q13401 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
PMS2P3Q13401 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
PMS2P3Q13401 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
PMS2P3Q13401 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
PMS2P3Q13401 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
PMS2P3Q13401 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
PMS2P3Q13401 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.86
PMS2P3Q13401 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC20.39■□□□□ 0.86
PMS2P3Q13401 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
PMS2P3Q13401 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
PMS2P3Q13401 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
PMS2P3Q13401 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
PMS2P3Q13401 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC20.39■□□□□ 0.85
PMS2P3Q13401 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
PMS2P3Q13401 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
PMS2P3Q13401 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
PMS2P3Q13401 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
PMS2P3Q13401 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
PMS2P3Q13401 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
PMS2P3Q13401 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
PMS2P3Q13401 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
PMS2P3Q13401 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
PMS2P3Q13401 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
PMS2P3Q13401 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
PMS2P3Q13401 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
PMS2P3Q13401 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
PMS2P3Q13401 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
PMS2P3Q13401 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
PMS2P3Q13401 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
PMS2P3Q13401 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
PMS2P3Q13401 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
PMS2P3Q13401 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
PMS2P3Q13401 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
PMS2P3Q13401 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
PMS2P3Q13401 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC20.38■□□□□ 0.85
PMS2P3Q13401 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
PMS2P3Q13401 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
PMS2P3Q13401 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
PMS2P3Q13401 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
PMS2P3Q13401 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
PMS2P3Q13401 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
PMS2P3Q13401 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
PMS2P3Q13401 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
PMS2P3Q13401 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
PMS2P3Q13401 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
PMS2P3Q13401 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
PMS2P3Q13401 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
PMS2P3Q13401 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
PMS2P3Q13401 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
PMS2P3Q13401 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
PMS2P3Q13401 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
PMS2P3Q13401 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
PMS2P3Q13401 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
PMS2P3Q13401 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
PMS2P3Q13401 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
PMS2P3Q13401 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
PMS2P3Q13401 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
PMS2P3Q13401 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
PMS2P3Q13401 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
PMS2P3Q13401 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
PMS2P3Q13401 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
PMS2P3Q13401 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
PMS2P3Q13401 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
PMS2P3Q13401 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
PMS2P3Q13401 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
PMS2P3Q13401 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
PMS2P3Q13401 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
PMS2P3Q13401 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
PMS2P3Q13401 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
PMS2P3Q13401 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
PMS2P3Q13401 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
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