Protein–RNA interactions for Protein: Q13315

ATM, Serine-protein kinase ATM, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATMQ13315 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
ATMQ13315 AC044860.1-201ENST00000560756 1160 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
ATMQ13315 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
ATMQ13315 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
ATMQ13315 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
ATMQ13315 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
ATMQ13315 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
ATMQ13315 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
ATMQ13315 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
ATMQ13315 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
ATMQ13315 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
ATMQ13315 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
ATMQ13315 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
ATMQ13315 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
ATMQ13315 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
ATMQ13315 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
ATMQ13315 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
ATMQ13315 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
ATMQ13315 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
ATMQ13315 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
ATMQ13315 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
ATMQ13315 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
ATMQ13315 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC20.23■□□□□ 0.83
ATMQ13315 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
ATMQ13315 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
ATMQ13315 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
ATMQ13315 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC20.23■□□□□ 0.83
ATMQ13315 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
ATMQ13315 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
ATMQ13315 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
ATMQ13315 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
ATMQ13315 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
ATMQ13315 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
ATMQ13315 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
ATMQ13315 PEX26-203ENST00000428061 815 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
ATMQ13315 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
ATMQ13315 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
ATMQ13315 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
ATMQ13315 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
ATMQ13315 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
ATMQ13315 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
ATMQ13315 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
ATMQ13315 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC20.22■□□□□ 0.83
ATMQ13315 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
ATMQ13315 SLC35A2-202ENST00000376512 903 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
ATMQ13315 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
ATMQ13315 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
ATMQ13315 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
ATMQ13315 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
ATMQ13315 AQP12B-201ENST00000407834 1094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
ATMQ13315 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
ATMQ13315 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
ATMQ13315 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
ATMQ13315 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC20.21■□□□□ 0.83
ATMQ13315 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
ATMQ13315 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
ATMQ13315 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
ATMQ13315 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
ATMQ13315 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
ATMQ13315 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
ATMQ13315 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
ATMQ13315 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC20.21■□□□□ 0.83
ATMQ13315 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.21■□□□□ 0.83
ATMQ13315 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
ATMQ13315 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
ATMQ13315 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
ATMQ13315 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
ATMQ13315 CAPN10-203ENST00000352879 862 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
ATMQ13315 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
ATMQ13315 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC20.21■□□□□ 0.83
ATMQ13315 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
ATMQ13315 SGO1-AS1-202ENST00000448208 819 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
ATMQ13315 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
ATMQ13315 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
ATMQ13315 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
ATMQ13315 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
ATMQ13315 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
ATMQ13315 RARRES1-204ENST00000479756 839 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
ATMQ13315 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
ATMQ13315 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ATMQ13315 HOXD12-201ENST00000404162 841 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ATMQ13315 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
ATMQ13315 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ATMQ13315 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
ATMQ13315 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
ATMQ13315 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ATMQ13315 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
ATMQ13315 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ATMQ13315 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
ATMQ13315 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ATMQ13315 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
ATMQ13315 AC100835.1-201ENST00000565737 498 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
ATMQ13315 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
ATMQ13315 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ATMQ13315 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ATMQ13315 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
ATMQ13315 DNPH1-202ENST00000393987 796 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
ATMQ13315 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
ATMQ13315 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ATMQ13315 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
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