Protein–RNA interactions for Protein: Q13200

PSMD2, 26S proteasome non-ATPase regulatory subunit 2, humanhuman

Predictions only

Length 908 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMD2Q13200 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
PSMD2Q13200 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PSMD2Q13200 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
PSMD2Q13200 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PSMD2Q13200 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PSMD2Q13200 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
PSMD2Q13200 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
PSMD2Q13200 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
PSMD2Q13200 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
PSMD2Q13200 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
PSMD2Q13200 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
PSMD2Q13200 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PSMD2Q13200 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
PSMD2Q13200 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PSMD2Q13200 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
PSMD2Q13200 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
PSMD2Q13200 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PSMD2Q13200 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PSMD2Q13200 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PSMD2Q13200 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PSMD2Q13200 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
PSMD2Q13200 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PSMD2Q13200 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PSMD2Q13200 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PSMD2Q13200 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
PSMD2Q13200 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PSMD2Q13200 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PSMD2Q13200 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
PSMD2Q13200 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
PSMD2Q13200 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
PSMD2Q13200 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PSMD2Q13200 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PSMD2Q13200 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
PSMD2Q13200 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PSMD2Q13200 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PSMD2Q13200 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
PSMD2Q13200 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
PSMD2Q13200 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
PSMD2Q13200 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
PSMD2Q13200 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
PSMD2Q13200 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PSMD2Q13200 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PSMD2Q13200 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PSMD2Q13200 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PSMD2Q13200 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PSMD2Q13200 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PSMD2Q13200 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
PSMD2Q13200 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
PSMD2Q13200 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.47
PSMD2Q13200 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
PSMD2Q13200 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
PSMD2Q13200 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
PSMD2Q13200 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
PSMD2Q13200 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
PSMD2Q13200 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
PSMD2Q13200 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
PSMD2Q13200 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
PSMD2Q13200 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
PSMD2Q13200 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
PSMD2Q13200 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
PSMD2Q13200 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
PSMD2Q13200 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
PSMD2Q13200 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
PSMD2Q13200 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
PSMD2Q13200 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
PSMD2Q13200 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC24.19■■□□□ 1.46
PSMD2Q13200 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PSMD2Q13200 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
PSMD2Q13200 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
PSMD2Q13200 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PSMD2Q13200 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PSMD2Q13200 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
PSMD2Q13200 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
PSMD2Q13200 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PSMD2Q13200 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
PSMD2Q13200 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PSMD2Q13200 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PSMD2Q13200 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
PSMD2Q13200 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
PSMD2Q13200 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
PSMD2Q13200 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PSMD2Q13200 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
PSMD2Q13200 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
PSMD2Q13200 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
PSMD2Q13200 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
PSMD2Q13200 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PSMD2Q13200 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
PSMD2Q13200 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
PSMD2Q13200 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PSMD2Q13200 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
PSMD2Q13200 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
PSMD2Q13200 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
PSMD2Q13200 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PSMD2Q13200 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
PSMD2Q13200 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PSMD2Q13200 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PSMD2Q13200 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
PSMD2Q13200 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PSMD2Q13200 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PSMD2Q13200 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15 ms