Protein–RNA interactions for Protein: Q12986

NFX1, Transcriptional repressor NF-X1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,120 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NFX1Q12986 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
NFX1Q12986 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC24.14■■□□□ 1.45
NFX1Q12986 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
NFX1Q12986 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
NFX1Q12986 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
NFX1Q12986 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
NFX1Q12986 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
NFX1Q12986 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
NFX1Q12986 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
NFX1Q12986 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
NFX1Q12986 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
NFX1Q12986 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
NFX1Q12986 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC24.13■■□□□ 1.45
NFX1Q12986 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
NFX1Q12986 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
NFX1Q12986 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
NFX1Q12986 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
NFX1Q12986 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
NFX1Q12986 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
NFX1Q12986 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
NFX1Q12986 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
NFX1Q12986 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
NFX1Q12986 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
NFX1Q12986 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
NFX1Q12986 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
NFX1Q12986 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
NFX1Q12986 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC24.12■■□□□ 1.45
NFX1Q12986 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
NFX1Q12986 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
NFX1Q12986 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
NFX1Q12986 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
NFX1Q12986 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
NFX1Q12986 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC24.11■■□□□ 1.45
NFX1Q12986 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC24.11■■□□□ 1.45
NFX1Q12986 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
NFX1Q12986 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
NFX1Q12986 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
NFX1Q12986 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
NFX1Q12986 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
NFX1Q12986 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
NFX1Q12986 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
NFX1Q12986 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
NFX1Q12986 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC24.1■■□□□ 1.45
NFX1Q12986 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
NFX1Q12986 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
NFX1Q12986 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
NFX1Q12986 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
NFX1Q12986 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
NFX1Q12986 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
NFX1Q12986 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
NFX1Q12986 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
NFX1Q12986 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
NFX1Q12986 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
NFX1Q12986 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
NFX1Q12986 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
NFX1Q12986 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
NFX1Q12986 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
NFX1Q12986 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
NFX1Q12986 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
NFX1Q12986 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
NFX1Q12986 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
NFX1Q12986 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
NFX1Q12986 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
NFX1Q12986 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
NFX1Q12986 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
NFX1Q12986 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC24.09■■□□□ 1.45
NFX1Q12986 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
NFX1Q12986 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
NFX1Q12986 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
NFX1Q12986 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
NFX1Q12986 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
NFX1Q12986 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
NFX1Q12986 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
NFX1Q12986 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
NFX1Q12986 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
NFX1Q12986 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
NFX1Q12986 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC24.08■■□□□ 1.45
NFX1Q12986 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
NFX1Q12986 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
NFX1Q12986 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
NFX1Q12986 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
NFX1Q12986 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
NFX1Q12986 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.44
NFX1Q12986 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.44
NFX1Q12986 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
NFX1Q12986 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
NFX1Q12986 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
NFX1Q12986 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
NFX1Q12986 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
NFX1Q12986 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
NFX1Q12986 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
NFX1Q12986 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
NFX1Q12986 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
NFX1Q12986 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
NFX1Q12986 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
NFX1Q12986 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
NFX1Q12986 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
NFX1Q12986 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
NFX1Q12986 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
NFX1Q12986 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
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