Protein–RNA interactions for Protein: Q12860

CNTN1, Contactin-1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNTN1Q12860 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CNTN1Q12860 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CNTN1Q12860 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CNTN1Q12860 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CNTN1Q12860 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
CNTN1Q12860 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CNTN1Q12860 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CNTN1Q12860 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CNTN1Q12860 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CNTN1Q12860 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CNTN1Q12860 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CNTN1Q12860 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CNTN1Q12860 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CNTN1Q12860 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CNTN1Q12860 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CNTN1Q12860 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CNTN1Q12860 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CNTN1Q12860 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CNTN1Q12860 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CNTN1Q12860 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CNTN1Q12860 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CNTN1Q12860 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CNTN1Q12860 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CNTN1Q12860 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CNTN1Q12860 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CNTN1Q12860 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CNTN1Q12860 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CNTN1Q12860 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CNTN1Q12860 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CNTN1Q12860 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CNTN1Q12860 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CNTN1Q12860 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
CNTN1Q12860 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CNTN1Q12860 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CNTN1Q12860 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
CNTN1Q12860 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
CNTN1Q12860 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
CNTN1Q12860 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CNTN1Q12860 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CNTN1Q12860 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CNTN1Q12860 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CNTN1Q12860 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CNTN1Q12860 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CNTN1Q12860 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CNTN1Q12860 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CNTN1Q12860 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CNTN1Q12860 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CNTN1Q12860 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CNTN1Q12860 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CNTN1Q12860 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CNTN1Q12860 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CNTN1Q12860 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CNTN1Q12860 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CNTN1Q12860 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
CNTN1Q12860 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CNTN1Q12860 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CNTN1Q12860 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CNTN1Q12860 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CNTN1Q12860 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
CNTN1Q12860 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
CNTN1Q12860 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC22■■□□□ 1.11
CNTN1Q12860 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC22■■□□□ 1.11
CNTN1Q12860 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC22■■□□□ 1.11
CNTN1Q12860 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CNTN1Q12860 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
CNTN1Q12860 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CNTN1Q12860 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
CNTN1Q12860 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CNTN1Q12860 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CNTN1Q12860 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CNTN1Q12860 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CNTN1Q12860 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CNTN1Q12860 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CNTN1Q12860 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CNTN1Q12860 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CNTN1Q12860 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CNTN1Q12860 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CNTN1Q12860 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CNTN1Q12860 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CNTN1Q12860 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CNTN1Q12860 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CNTN1Q12860 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CNTN1Q12860 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CNTN1Q12860 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CNTN1Q12860 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CNTN1Q12860 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CNTN1Q12860 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CNTN1Q12860 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CNTN1Q12860 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CNTN1Q12860 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CNTN1Q12860 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
CNTN1Q12860 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
CNTN1Q12860 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CNTN1Q12860 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CNTN1Q12860 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CNTN1Q12860 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CNTN1Q12860 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CNTN1Q12860 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CNTN1Q12860 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CNTN1Q12860 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
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