Protein–RNA interactions for Protein: Q12229

UBX3, UBX domain-containing protein 3, yeastyeast

Predictions only

Length 455 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
UBX3Q12229 RUF5-1RUF5-1 710 nt4.29□□□□□ -1.72
UBX3Q12229 RUF5-2RUF5-2 710 nt4.29□□□□□ -1.72
UBX3Q12229 YOL118CYOL118C 309 nt4.29□□□□□ -1.72
UBX3Q12229 SUA7YPR086W 1038 nt4.29□□□□□ -1.72
UBX3Q12229 PBP2YBR233W 1242 nt4.29□□□□□ -1.72
UBX3Q12229 YKR015CYKR015C 1707 nt4.29□□□□□ -1.72
UBX3Q12229 NPL4YBR170C 1743 nt4.29□□□□□ -1.72
UBX3Q12229 MAK11YKL021C 1407 nt4.29□□□□□ -1.72
UBX3Q12229 RKM3YBR030W 1659 nt4.29□□□□□ -1.72
UBX3Q12229 MDM34YGL219C 1380 nt4.28□□□□□ -1.72
UBX3Q12229 BCH2YKR027W 2298 nt4.28□□□□□ -1.72
UBX3Q12229 MMT1YMR177W 1533 nt4.28□□□□□ -1.72
UBX3Q12229 CPR1YDR155C 489 nt4.28□□□□□ -1.72
UBX3Q12229 BNA6YFR047C 888 nt4.28□□□□□ -1.72
UBX3Q12229 KXD1YGL079W 657 nt4.28□□□□□ -1.72
UBX3Q12229 LST7YGR057C 729 nt4.28□□□□□ -1.72
UBX3Q12229 DAL2YIR029W 1032 nt4.28□□□□□ -1.72
UBX3Q12229 SMD3YLR147C 306 nt4.28□□□□□ -1.72
UBX3Q12229 END3YNL084C 1050 nt4.28□□□□□ -1.72
UBX3Q12229 MDJ2YNL328C 441 nt4.28□□□□□ -1.72
UBX3Q12229 IPP1YBR011C 864 nt4.28□□□□□ -1.72
UBX3Q12229 IAH1YOR126C 717 nt4.28□□□□□ -1.72
UBX3Q12229 RTC1YOL138C 4026 nt4.28□□□□□ -1.72
UBX3Q12229 RPG1YBR079C 2895 nt4.28□□□□□ -1.72
UBX3Q12229 IDS2YJL146W 1410 nt4.28□□□□□ -1.72
UBX3Q12229 PDR5YOR153W 4536 nt4.27□□□□□ -1.73
UBX3Q12229 SSH4YKL124W 1740 nt4.27□□□□□ -1.73
UBX3Q12229 SRB5YGR104C 924 nt4.27□□□□□ -1.73
UBX3Q12229 YHR069C-AYHR069C-A 363 nt4.27□□□□□ -1.73
UBX3Q12229 YJL032WYJL032W 315 nt4.27□□□□□ -1.73
UBX3Q12229 YLR271WYLR271W 825 nt4.27□□□□□ -1.73
UBX3Q12229 YLR363W-AYLR363W-A 258 nt4.27□□□□□ -1.73
UBX3Q12229 POP8YBL018C 402 nt4.27□□□□□ -1.73
UBX3Q12229 CDC21YOR074C 915 nt4.27□□□□□ -1.73
UBX3Q12229 YPL278CYPL278C 303 nt4.27□□□□□ -1.73
UBX3Q12229 YPR142CYPR142C 564 nt4.27□□□□□ -1.73
UBX3Q12229 RRP15YPR143W 753 nt4.27□□□□□ -1.73
UBX3Q12229 NCE102YPR149W 522 nt4.27□□□□□ -1.73
UBX3Q12229 snR37snR37 386 nt4.27□□□□□ -1.73
UBX3Q12229 YCL021W-AYCL021W-A 378 nt4.27□□□□□ -1.73
UBX3Q12229 BRE4YDL231C 3378 nt4.27□□□□□ -1.73
UBX3Q12229 YCR023CYCR023C 1836 nt4.27□□□□□ -1.73
UBX3Q12229 HOYDL227C 1761 nt4.27□□□□□ -1.73
UBX3Q12229 MDR1YGR100W 2853 nt4.27□□□□□ -1.73
UBX3Q12229 OLE1YGL055W 1533 nt4.26□□□□□ -1.73
UBX3Q12229 PTR3YFR029W 2037 nt4.26□□□□□ -1.73
UBX3Q12229 PUF2YPR042C 3228 nt4.26□□□□□ -1.73
UBX3Q12229 PLP1YDR183W 693 nt4.26□□□□□ -1.73
UBX3Q12229 YKL091CYKL091C 933 nt4.26□□□□□ -1.73
UBX3Q12229 MTD1YKR080W 963 nt4.26□□□□□ -1.73
UBX3Q12229 PER33YLR064W 822 nt4.26□□□□□ -1.73
UBX3Q12229 YLR163W-AYLR163W-A 114 nt4.26□□□□□ -1.73
UBX3Q12229 RNA1YMR235C 1224 nt4.26□□□□□ -1.73
UBX3Q12229 YBL094CYBL094C 333 nt4.26□□□□□ -1.73
UBX3Q12229 MCT1YOR221C 1083 nt4.26□□□□□ -1.73
UBX3Q12229 YPL068CYPL068C 882 nt4.26□□□□□ -1.73
UBX3Q12229 YPR071WYPR071W 636 nt4.26□□□□□ -1.73
UBX3Q12229 OM14YBR230C 405 nt4.26□□□□□ -1.73
UBX3Q12229 PHO87YCR037C 2772 nt4.26□□□□□ -1.73
UBX3Q12229 ALR2YFL050C 2577 nt4.26□□□□□ -1.73
UBX3Q12229 UGA3YDL170W 1587 nt4.26□□□□□ -1.73
UBX3Q12229 LYP1YNL268W 1836 nt4.25□□□□□ -1.73
UBX3Q12229 SYF1YDR416W 2580 nt4.25□□□□□ -1.73
UBX3Q12229 NAM2YLR382C 2685 nt4.25□□□□□ -1.73
UBX3Q12229 RPB7YDR404C 516 nt4.25□□□□□ -1.73
UBX3Q12229 GSM1YJL103C 1857 nt4.25□□□□□ -1.73
UBX3Q12229 YAR023CYAR023C 540 nt4.25□□□□□ -1.73
UBX3Q12229 YLR156WYLR156W 345 nt4.25□□□□□ -1.73
UBX3Q12229 YLR157W-DYLR157W-D 213 nt4.25□□□□□ -1.73
UBX3Q12229 YLR159WYLR159W 345 nt4.25□□□□□ -1.73
UBX3Q12229 YLR161WYLR161W 345 nt4.25□□□□□ -1.73
UBX3Q12229 CDC42YLR229C 576 nt4.25□□□□□ -1.73
UBX3Q12229 PEX30YLR324W 1572 nt4.25□□□□□ -1.73
UBX3Q12229 URA5YML106W 681 nt4.25□□□□□ -1.73
UBX3Q12229 YNR061CYNR061C 660 nt4.25□□□□□ -1.73
UBX3Q12229 IZH4YOL101C 939 nt4.25□□□□□ -1.73
UBX3Q12229 ARL3YPL051W 597 nt4.25□□□□□ -1.73
UBX3Q12229 YPR027CYPR027C 834 nt4.25□□□□□ -1.73
UBX3Q12229 ALG9YNL219C 1668 nt4.25□□□□□ -1.73
UBX3Q12229 NUF2YOL069W 1356 nt4.25□□□□□ -1.73
UBX3Q12229 YER077CYER077C 2067 nt4.25□□□□□ -1.73
UBX3Q12229 TDA6YPR157W 1404 nt4.24□□□□□ -1.73
UBX3Q12229 YCR015CYCR015C 954 nt4.24□□□□□ -1.73
UBX3Q12229 SPO11YHL022C 1197 nt4.24□□□□□ -1.73
UBX3Q12229 YJL156W-AYJL156W-A 222 nt4.24□□□□□ -1.73
UBX3Q12229 YJR071WYJR071W 369 nt4.24□□□□□ -1.73
UBX3Q12229 NKP2YLR315W 462 nt4.24□□□□□ -1.73
UBX3Q12229 DPH6YLR143W 2058 nt4.24□□□□□ -1.73
UBX3Q12229 FBP26YJL155C 1359 nt4.24□□□□□ -1.73
UBX3Q12229 YGR266WYGR266W 2106 nt4.24□□□□□ -1.73
UBX3Q12229 APM3YBR288C 1452 nt4.24□□□□□ -1.73
UBX3Q12229 THS1YIL078W 2205 nt4.23□□□□□ -1.73
UBX3Q12229 XKS1YGR194C 1803 nt4.23□□□□□ -1.73
UBX3Q12229 DBP5YOR046C 1449 nt4.23□□□□□ -1.73
UBX3Q12229 STB3YDR169C 1542 nt4.23□□□□□ -1.73
UBX3Q12229 JLP1YLL057C 1239 nt4.23□□□□□ -1.73
UBX3Q12229 GAT3YLR013W 426 nt4.23□□□□□ -1.73
UBX3Q12229 YAR030CYAR030C 342 nt4.23□□□□□ -1.73
UBX3Q12229 YLR202CYLR202C 327 nt4.23□□□□□ -1.73
UBX3Q12229 YLR407WYLR407W 687 nt4.23□□□□□ -1.73
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 22.1 ms