Protein–RNA interactions for Protein: Q0VAQ4

SMAGP, Small cell adhesion glycoprotein, humanhuman

Predictions only

Length 97 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMAGPQ0VAQ4 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
SMAGPQ0VAQ4 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
SMAGPQ0VAQ4 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
SMAGPQ0VAQ4 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
SMAGPQ0VAQ4 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
SMAGPQ0VAQ4 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
SMAGPQ0VAQ4 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
SMAGPQ0VAQ4 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
SMAGPQ0VAQ4 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
SMAGPQ0VAQ4 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
SMAGPQ0VAQ4 DAG1-219ENST00000538711 5582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
SMAGPQ0VAQ4 RETREG2-203ENST00000430297 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
SMAGPQ0VAQ4 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
SMAGPQ0VAQ4 CNOT6-201ENST00000261951 6176 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
SMAGPQ0VAQ4 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
SMAGPQ0VAQ4 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
SMAGPQ0VAQ4 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
SMAGPQ0VAQ4 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
SMAGPQ0VAQ4 HR-202ENST00000381418 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
SMAGPQ0VAQ4 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
SMAGPQ0VAQ4 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
SMAGPQ0VAQ4 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
SMAGPQ0VAQ4 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
SMAGPQ0VAQ4 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
SMAGPQ0VAQ4 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
SMAGPQ0VAQ4 DIO3-201ENST00000510508 2102 ntAPPRIS P1 BASIC15.67■□□□□ 0.1
SMAGPQ0VAQ4 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
SMAGPQ0VAQ4 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
SMAGPQ0VAQ4 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
SMAGPQ0VAQ4 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
SMAGPQ0VAQ4 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
SMAGPQ0VAQ4 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
SMAGPQ0VAQ4 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
SMAGPQ0VAQ4 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
SMAGPQ0VAQ4 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
SMAGPQ0VAQ4 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
SMAGPQ0VAQ4 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
SMAGPQ0VAQ4 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
SMAGPQ0VAQ4 AP001626.1-201ENST00000424890 2854 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
SMAGPQ0VAQ4 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
SMAGPQ0VAQ4 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
SMAGPQ0VAQ4 AVPR1A-201ENST00000299178 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
SMAGPQ0VAQ4 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
SMAGPQ0VAQ4 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
SMAGPQ0VAQ4 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
SMAGPQ0VAQ4 FOXD2-201ENST00000334793 4675 ntAPPRIS P1 BASIC15.66■□□□□ 0.1
SMAGPQ0VAQ4 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
SMAGPQ0VAQ4 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
SMAGPQ0VAQ4 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
SMAGPQ0VAQ4 EMX2-201ENST00000442245 2710 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
SMAGPQ0VAQ4 GATAD1-201ENST00000287957 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
SMAGPQ0VAQ4 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
SMAGPQ0VAQ4 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
SMAGPQ0VAQ4 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
SMAGPQ0VAQ4 MRC2-201ENST00000303375 5988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
SMAGPQ0VAQ4 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
SMAGPQ0VAQ4 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
SMAGPQ0VAQ4 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
SMAGPQ0VAQ4 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
SMAGPQ0VAQ4 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
SMAGPQ0VAQ4 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
SMAGPQ0VAQ4 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
SMAGPQ0VAQ4 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
SMAGPQ0VAQ4 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
SMAGPQ0VAQ4 ISLR2-201ENST00000361742 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
SMAGPQ0VAQ4 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
SMAGPQ0VAQ4 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
SMAGPQ0VAQ4 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC15.65■□□□□ 0.1
SMAGPQ0VAQ4 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
SMAGPQ0VAQ4 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
SMAGPQ0VAQ4 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
SMAGPQ0VAQ4 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
SMAGPQ0VAQ4 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
SMAGPQ0VAQ4 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
SMAGPQ0VAQ4 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SMAGPQ0VAQ4 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SMAGPQ0VAQ4 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SMAGPQ0VAQ4 ELL2-201ENST00000237853 6046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SMAGPQ0VAQ4 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SMAGPQ0VAQ4 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SMAGPQ0VAQ4 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SMAGPQ0VAQ4 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SMAGPQ0VAQ4 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
SMAGPQ0VAQ4 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
SMAGPQ0VAQ4 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SMAGPQ0VAQ4 RALGAPA1-219ENST00000637992 8512 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SMAGPQ0VAQ4 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SMAGPQ0VAQ4 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SMAGPQ0VAQ4 NPLOC4-201ENST00000331134 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SMAGPQ0VAQ4 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SMAGPQ0VAQ4 KIAA1522-204ENST00000401073 5438 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SMAGPQ0VAQ4 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SMAGPQ0VAQ4 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SMAGPQ0VAQ4 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SMAGPQ0VAQ4 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SMAGPQ0VAQ4 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SMAGPQ0VAQ4 CACNA1A-201ENST00000360228 8627 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SMAGPQ0VAQ4 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SMAGPQ0VAQ4 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SMAGPQ0VAQ4 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.6 ms