Protein–RNA interactions for Protein: Q0D2K3

RIPPLY1, Protein ripply1, humanhuman

Predictions only

Length 151 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RIPPLY1Q0D2K3 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
RIPPLY1Q0D2K3 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
RIPPLY1Q0D2K3 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
RIPPLY1Q0D2K3 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
RIPPLY1Q0D2K3 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
RIPPLY1Q0D2K3 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
RIPPLY1Q0D2K3 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
RIPPLY1Q0D2K3 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
RIPPLY1Q0D2K3 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
RIPPLY1Q0D2K3 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
RIPPLY1Q0D2K3 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
RIPPLY1Q0D2K3 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
RIPPLY1Q0D2K3 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
RIPPLY1Q0D2K3 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
RIPPLY1Q0D2K3 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
RIPPLY1Q0D2K3 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
RIPPLY1Q0D2K3 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
RIPPLY1Q0D2K3 XYLT1-201ENST00000261381 9891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
RIPPLY1Q0D2K3 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
RIPPLY1Q0D2K3 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
RIPPLY1Q0D2K3 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
RIPPLY1Q0D2K3 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
RIPPLY1Q0D2K3 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
RIPPLY1Q0D2K3 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
RIPPLY1Q0D2K3 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC19.18■□□□□ 0.66
RIPPLY1Q0D2K3 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
RIPPLY1Q0D2K3 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
RIPPLY1Q0D2K3 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
RIPPLY1Q0D2K3 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
RIPPLY1Q0D2K3 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
RIPPLY1Q0D2K3 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
RIPPLY1Q0D2K3 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
RIPPLY1Q0D2K3 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
RIPPLY1Q0D2K3 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
RIPPLY1Q0D2K3 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
RIPPLY1Q0D2K3 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
RIPPLY1Q0D2K3 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC19.17■□□□□ 0.66
RIPPLY1Q0D2K3 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
RIPPLY1Q0D2K3 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
RIPPLY1Q0D2K3 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
RIPPLY1Q0D2K3 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
RIPPLY1Q0D2K3 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
RIPPLY1Q0D2K3 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC19.17■□□□□ 0.66
RIPPLY1Q0D2K3 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
RIPPLY1Q0D2K3 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
RIPPLY1Q0D2K3 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
RIPPLY1Q0D2K3 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
RIPPLY1Q0D2K3 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
RIPPLY1Q0D2K3 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
RIPPLY1Q0D2K3 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
RIPPLY1Q0D2K3 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC19.16■□□□□ 0.66
RIPPLY1Q0D2K3 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
RIPPLY1Q0D2K3 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
RIPPLY1Q0D2K3 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
RIPPLY1Q0D2K3 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
RIPPLY1Q0D2K3 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
RIPPLY1Q0D2K3 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
RIPPLY1Q0D2K3 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
RIPPLY1Q0D2K3 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
RIPPLY1Q0D2K3 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
RIPPLY1Q0D2K3 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
RIPPLY1Q0D2K3 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
RIPPLY1Q0D2K3 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
RIPPLY1Q0D2K3 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
RIPPLY1Q0D2K3 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
RIPPLY1Q0D2K3 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
RIPPLY1Q0D2K3 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
RIPPLY1Q0D2K3 POU3F2-201ENST00000328345 4879 ntAPPRIS P1 BASIC19.15■□□□□ 0.66
RIPPLY1Q0D2K3 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
RIPPLY1Q0D2K3 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
RIPPLY1Q0D2K3 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
RIPPLY1Q0D2K3 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC19.15■□□□□ 0.66
RIPPLY1Q0D2K3 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
RIPPLY1Q0D2K3 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
RIPPLY1Q0D2K3 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
RIPPLY1Q0D2K3 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
RIPPLY1Q0D2K3 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
RIPPLY1Q0D2K3 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
RIPPLY1Q0D2K3 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
RIPPLY1Q0D2K3 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
RIPPLY1Q0D2K3 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
RIPPLY1Q0D2K3 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
RIPPLY1Q0D2K3 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
RIPPLY1Q0D2K3 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
RIPPLY1Q0D2K3 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
RIPPLY1Q0D2K3 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
RIPPLY1Q0D2K3 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
RIPPLY1Q0D2K3 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
RIPPLY1Q0D2K3 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
RIPPLY1Q0D2K3 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
RIPPLY1Q0D2K3 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
RIPPLY1Q0D2K3 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
RIPPLY1Q0D2K3 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
RIPPLY1Q0D2K3 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
RIPPLY1Q0D2K3 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
RIPPLY1Q0D2K3 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
RIPPLY1Q0D2K3 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
RIPPLY1Q0D2K3 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
RIPPLY1Q0D2K3 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
RIPPLY1Q0D2K3 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.5 ms