Protein–RNA interactions for Protein: Q0D2I5

IFFO1, Intermediate filament family orphan 1, humanhuman

Predictions only

Length 559 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFFO1Q0D2I5 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
IFFO1Q0D2I5 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
IFFO1Q0D2I5 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
IFFO1Q0D2I5 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
IFFO1Q0D2I5 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
IFFO1Q0D2I5 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
IFFO1Q0D2I5 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
IFFO1Q0D2I5 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
IFFO1Q0D2I5 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
IFFO1Q0D2I5 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
IFFO1Q0D2I5 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
IFFO1Q0D2I5 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
IFFO1Q0D2I5 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
IFFO1Q0D2I5 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
IFFO1Q0D2I5 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
IFFO1Q0D2I5 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
IFFO1Q0D2I5 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
IFFO1Q0D2I5 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
IFFO1Q0D2I5 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
IFFO1Q0D2I5 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
IFFO1Q0D2I5 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
IFFO1Q0D2I5 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
IFFO1Q0D2I5 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
IFFO1Q0D2I5 FAM20B-201ENST00000263733 5984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
IFFO1Q0D2I5 GLS-201ENST00000320717 4834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
IFFO1Q0D2I5 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
IFFO1Q0D2I5 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
IFFO1Q0D2I5 LMO4-202ENST00000370544 5405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
IFFO1Q0D2I5 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
IFFO1Q0D2I5 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
IFFO1Q0D2I5 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
IFFO1Q0D2I5 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
IFFO1Q0D2I5 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
IFFO1Q0D2I5 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
IFFO1Q0D2I5 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
IFFO1Q0D2I5 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
IFFO1Q0D2I5 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
IFFO1Q0D2I5 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
IFFO1Q0D2I5 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
IFFO1Q0D2I5 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
IFFO1Q0D2I5 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
IFFO1Q0D2I5 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
IFFO1Q0D2I5 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
IFFO1Q0D2I5 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
IFFO1Q0D2I5 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
IFFO1Q0D2I5 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
IFFO1Q0D2I5 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
IFFO1Q0D2I5 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.18
IFFO1Q0D2I5 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
IFFO1Q0D2I5 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
IFFO1Q0D2I5 BRPF3-202ENST00000357641 6052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
IFFO1Q0D2I5 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
IFFO1Q0D2I5 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
IFFO1Q0D2I5 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
IFFO1Q0D2I5 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
IFFO1Q0D2I5 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
IFFO1Q0D2I5 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
IFFO1Q0D2I5 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
IFFO1Q0D2I5 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
IFFO1Q0D2I5 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
IFFO1Q0D2I5 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
IFFO1Q0D2I5 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
IFFO1Q0D2I5 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
IFFO1Q0D2I5 PIP5K1C-201ENST00000335312 5080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
IFFO1Q0D2I5 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
IFFO1Q0D2I5 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
IFFO1Q0D2I5 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
IFFO1Q0D2I5 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
IFFO1Q0D2I5 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
IFFO1Q0D2I5 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
IFFO1Q0D2I5 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
IFFO1Q0D2I5 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
IFFO1Q0D2I5 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
IFFO1Q0D2I5 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
IFFO1Q0D2I5 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
IFFO1Q0D2I5 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
IFFO1Q0D2I5 KCNQ5-201ENST00000342056 6688 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
IFFO1Q0D2I5 ADGRB1-201ENST00000323289 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
IFFO1Q0D2I5 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
IFFO1Q0D2I5 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
IFFO1Q0D2I5 HCG18-235ENST00000426882 4862 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
IFFO1Q0D2I5 HOOK1-201ENST00000371208 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
IFFO1Q0D2I5 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
IFFO1Q0D2I5 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
IFFO1Q0D2I5 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
IFFO1Q0D2I5 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
IFFO1Q0D2I5 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
IFFO1Q0D2I5 PHKA1-204ENST00000373545 6173 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
IFFO1Q0D2I5 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
IFFO1Q0D2I5 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
IFFO1Q0D2I5 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
IFFO1Q0D2I5 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
IFFO1Q0D2I5 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
IFFO1Q0D2I5 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
IFFO1Q0D2I5 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
IFFO1Q0D2I5 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
IFFO1Q0D2I5 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
IFFO1Q0D2I5 ROR1-201ENST00000371079 5832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
IFFO1Q0D2I5 SPTBN4-207ENST00000595535 6105 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
IFFO1Q0D2I5 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.8 ms