Protein–RNA interactions for Protein: Q08236

AVO1, Target of rapamycin complex 2 subunit AVO1, yeastyeast

Predictions only

Length 1,176 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
AVO1Q08236 GUA1YMR217W 1578 nt5.39□□□□□ -1.55
AVO1Q08236 YTA6YPL074W 2265 nt5.39□□□□□ -1.55
AVO1Q08236 YFR035CYFR035C 345 nt5.39□□□□□ -1.55
AVO1Q08236 PHB1YGR132C 864 nt5.39□□□□□ -1.55
AVO1Q08236 MRP4YHL004W 1185 nt5.39□□□□□ -1.55
AVO1Q08236 MRS1YIR021W 1092 nt5.39□□□□□ -1.55
AVO1Q08236 ZRT2YLR130C 1269 nt5.39□□□□□ -1.55
AVO1Q08236 RPS30AYLR287C-A 192 nt5.39□□□□□ -1.55
AVO1Q08236 CIN4YMR138W 576 nt5.39□□□□□ -1.55
AVO1Q08236 YOL159C-AYOL159C-A 273 nt5.39□□□□□ -1.55
AVO1Q08236 YOR314WYOR314W 330 nt5.39□□□□□ -1.55
AVO1Q08236 RPT4YOR259C 1314 nt5.39□□□□□ -1.55
AVO1Q08236 ENT1YDL161W 1365 nt5.39□□□□□ -1.55
AVO1Q08236 RUD3YOR216C 1455 nt5.39□□□□□ -1.55
AVO1Q08236 KEX2YNL238W 2445 nt5.38□□□□□ -1.55
AVO1Q08236 PDH1YPR002W 1551 nt5.38□□□□□ -1.55
AVO1Q08236 RPL35BYDL136W 363 nt5.38□□□□□ -1.55
AVO1Q08236 RSM18YER050C 417 nt5.38□□□□□ -1.55
AVO1Q08236 YFL051CYFL051C 483 nt5.38□□□□□ -1.55
AVO1Q08236 YGL006W-AYGL006W-A 111 nt5.38□□□□□ -1.55
AVO1Q08236 YGL242CYGL242C 546 nt5.38□□□□□ -1.55
AVO1Q08236 YGR160WYGR160W 612 nt5.38□□□□□ -1.55
AVO1Q08236 THP2YHR167W 786 nt5.38□□□□□ -1.55
AVO1Q08236 NFU1YKL040C 771 nt5.38□□□□□ -1.55
AVO1Q08236 COS1YNL336W 1146 nt5.38□□□□□ -1.55
AVO1Q08236 YOR105WYOR105W 327 nt5.38□□□□□ -1.55
AVO1Q08236 MLC2YPR188C 492 nt5.38□□□□□ -1.55
AVO1Q08236 CDC28YBR160W 897 nt5.38□□□□□ -1.55
AVO1Q08236 LEU1YGL009C 2340 nt5.38□□□□□ -1.55
AVO1Q08236 CLA4YNL298W 2529 nt5.38□□□□□ -1.55
AVO1Q08236 AVT2YEL064C 1443 nt5.38□□□□□ -1.55
AVO1Q08236 CNE1YAL058W 1509 nt5.38□□□□□ -1.55
AVO1Q08236 SIS2YKR072C 1689 nt5.37□□□□□ -1.55
AVO1Q08236 YRF1-4YLR466W 4149 nt5.37□□□□□ -1.55
AVO1Q08236 SHU2YDR078C 672 nt5.37□□□□□ -1.55
AVO1Q08236 RNR2YJL026W 1200 nt5.37□□□□□ -1.55
AVO1Q08236 GCD14YJL125C 1152 nt5.37□□□□□ -1.55
AVO1Q08236 JLP1YLL057C 1239 nt5.37□□□□□ -1.55
AVO1Q08236 ECI1YLR284C 843 nt5.37□□□□□ -1.55
AVO1Q08236 YMR010WYMR010W 1218 nt5.37□□□□□ -1.55
AVO1Q08236 TOA1YOR194C 861 nt5.37□□□□□ -1.55
AVO1Q08236 PDX3YBR035C 687 nt5.37□□□□□ -1.55
AVO1Q08236 MOT2YER068W 1764 nt5.37□□□□□ -1.55
AVO1Q08236 MSN4YKL062W 1893 nt5.37□□□□□ -1.55
AVO1Q08236 RGP1YDR137W 1992 nt5.36□□□□□ -1.55
AVO1Q08236 FRE3YOR381W 2136 nt5.36□□□□□ -1.55
AVO1Q08236 ABF1YKL112W 2196 nt5.36□□□□□ -1.55
AVO1Q08236 YDL172CYDL172C 480 nt5.36□□□□□ -1.55
AVO1Q08236 KEI1YDR367W 666 nt5.36□□□□□ -1.55
AVO1Q08236 YER158W-AYER158W-A 216 nt5.36□□□□□ -1.55
AVO1Q08236 MND1YGL183C 660 nt5.36□□□□□ -1.55
AVO1Q08236 TIM10YHR005C-A 282 nt5.36□□□□□ -1.55
AVO1Q08236 MET14YKL001C 609 nt5.36□□□□□ -1.55
AVO1Q08236 YKL023WYKL023W 834 nt5.36□□□□□ -1.55
AVO1Q08236 VMA5YKL080W 1179 nt5.36□□□□□ -1.55
AVO1Q08236 LST8YNL006W 912 nt5.36□□□□□ -1.55
AVO1Q08236 YOL029CYOL029C 606 nt5.36□□□□□ -1.55
AVO1Q08236 ERI1YPL096C-A 207 nt5.36□□□□□ -1.55
AVO1Q08236 ADE12YNL220W 1302 nt5.36□□□□□ -1.55
AVO1Q08236 POL31YJR006W 1464 nt5.36□□□□□ -1.55
AVO1Q08236 VPS30YPL120W 1674 nt5.36□□□□□ -1.55
AVO1Q08236 NPL4YBR170C 1743 nt5.36□□□□□ -1.55
AVO1Q08236 MPH2YDL247W 1830 nt5.36□□□□□ -1.55
AVO1Q08236 TSL1YML100W 3297 nt5.36□□□□□ -1.55
AVO1Q08236 DOA1YKL213C 2148 nt5.35□□□□□ -1.55
AVO1Q08236 YDL109CYDL109C 1944 nt5.35□□□□□ -1.55
AVO1Q08236 SMF1YOL122C 1728 nt5.35□□□□□ -1.55
AVO1Q08236 NOP8YOL144W 1455 nt5.35□□□□□ -1.55
AVO1Q08236 LYS21YDL131W 1323 nt5.35□□□□□ -1.55
AVO1Q08236 snR84snR84 550 nt5.35□□□□□ -1.55
AVO1Q08236 NKP1YDR383C 717 nt5.35□□□□□ -1.55
AVO1Q08236 YGL138CYGL138C 1038 nt5.35□□□□□ -1.55
AVO1Q08236 CIC1YHR052W 1131 nt5.35□□□□□ -1.55
AVO1Q08236 SUP2tY(GUA)D 75 nt5.35□□□□□ -1.55
AVO1Q08236 SUP11tY(GUA)F1 75 nt5.35□□□□□ -1.55
AVO1Q08236 SUP6tY(GUA)F2 75 nt5.35□□□□□ -1.55
AVO1Q08236 SUP7tY(GUA)J1 75 nt5.35□□□□□ -1.55
AVO1Q08236 SUP4tY(GUA)J2 75 nt5.35□□□□□ -1.55
AVO1Q08236 SUP5tY(GUA)M1 75 nt5.35□□□□□ -1.55
AVO1Q08236 SUP8tY(GUA)M2 75 nt5.35□□□□□ -1.55
AVO1Q08236 SUP3tY(GUA)O 75 nt5.35□□□□□ -1.55
AVO1Q08236 LOH1YJL038C 660 nt5.35□□□□□ -1.55
AVO1Q08236 CYC1YJR048W 330 nt5.35□□□□□ -1.55
AVO1Q08236 IMP2YMR035W 534 nt5.35□□□□□ -1.55
AVO1Q08236 TPP1YMR156C 717 nt5.35□□□□□ -1.55
AVO1Q08236 GIM3YNL153C 390 nt5.35□□□□□ -1.55
AVO1Q08236 PRM3YPL192C 402 nt5.35□□□□□ -1.55
AVO1Q08236 YBR126W-AYBR126W-A 207 nt5.35□□□□□ -1.55
AVO1Q08236 ERV15YBR210W 429 nt5.35□□□□□ -1.55
AVO1Q08236 NUP116YMR047C 3342 nt5.35□□□□□ -1.55
AVO1Q08236 SEC12YNR026C 1416 nt5.34□□□□□ -1.55
AVO1Q08236 PMT5YDL093W 2232 nt5.34□□□□□ -1.55
AVO1Q08236 DIG2YDR480W 972 nt5.34□□□□□ -1.55
AVO1Q08236 LYS5YGL154C 819 nt5.34□□□□□ -1.55
AVO1Q08236 YHR180WYHR180W 492 nt5.34□□□□□ -1.55
AVO1Q08236 SEN34YAR008W 828 nt5.34□□□□□ -1.55
AVO1Q08236 UPS2YLR168C 693 nt5.34□□□□□ -1.55
AVO1Q08236 YBL059WYBL059W 582 nt5.34□□□□□ -1.55
AVO1Q08236 MFM1YPL060W 1242 nt5.34□□□□□ -1.55
AVO1Q08236 PRI2YKL045W 1587 nt5.33□□□□□ -1.56
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 9.9 ms