Protein–RNA interactions for Protein: Q08188

TGM3, Protein-glutamine gamma-glutamyltransferase E, humanhuman

Predictions only

Length 693 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TGM3Q08188 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
TGM3Q08188 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
TGM3Q08188 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
TGM3Q08188 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
TGM3Q08188 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
TGM3Q08188 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
TGM3Q08188 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
TGM3Q08188 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
TGM3Q08188 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
TGM3Q08188 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
TGM3Q08188 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
TGM3Q08188 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
TGM3Q08188 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
TGM3Q08188 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
TGM3Q08188 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
TGM3Q08188 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
TGM3Q08188 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
TGM3Q08188 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
TGM3Q08188 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
TGM3Q08188 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
TGM3Q08188 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
TGM3Q08188 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC20.89■□□□□ 0.94
TGM3Q08188 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.94
TGM3Q08188 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
TGM3Q08188 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
TGM3Q08188 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC20.89■□□□□ 0.93
TGM3Q08188 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
TGM3Q08188 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
TGM3Q08188 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
TGM3Q08188 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
TGM3Q08188 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
TGM3Q08188 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
TGM3Q08188 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
TGM3Q08188 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC20.88■□□□□ 0.93
TGM3Q08188 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
TGM3Q08188 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
TGM3Q08188 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
TGM3Q08188 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
TGM3Q08188 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
TGM3Q08188 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
TGM3Q08188 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
TGM3Q08188 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
TGM3Q08188 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
TGM3Q08188 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
TGM3Q08188 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
TGM3Q08188 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
TGM3Q08188 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
TGM3Q08188 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
TGM3Q08188 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
TGM3Q08188 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
TGM3Q08188 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
TGM3Q08188 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
TGM3Q08188 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC20.87■□□□□ 0.93
TGM3Q08188 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
TGM3Q08188 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
TGM3Q08188 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
TGM3Q08188 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
TGM3Q08188 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
TGM3Q08188 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
TGM3Q08188 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
TGM3Q08188 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
TGM3Q08188 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
TGM3Q08188 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC20.87■□□□□ 0.93
TGM3Q08188 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
TGM3Q08188 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
TGM3Q08188 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
TGM3Q08188 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
TGM3Q08188 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
TGM3Q08188 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
TGM3Q08188 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
TGM3Q08188 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
TGM3Q08188 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
TGM3Q08188 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
TGM3Q08188 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
TGM3Q08188 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
TGM3Q08188 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
TGM3Q08188 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
TGM3Q08188 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
TGM3Q08188 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
TGM3Q08188 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
TGM3Q08188 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
TGM3Q08188 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
TGM3Q08188 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
TGM3Q08188 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
TGM3Q08188 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
TGM3Q08188 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
TGM3Q08188 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
TGM3Q08188 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
TGM3Q08188 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
TGM3Q08188 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
TGM3Q08188 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC20.85■□□□□ 0.93
TGM3Q08188 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
TGM3Q08188 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
TGM3Q08188 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
TGM3Q08188 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
TGM3Q08188 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
TGM3Q08188 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
TGM3Q08188 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
TGM3Q08188 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
TGM3Q08188 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17 ms