Protein–RNA interactions for Protein: Q08170

SRSF4, Serine/arginine-rich splicing factor 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 494 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRSF4Q08170 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SRSF4Q08170 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SRSF4Q08170 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SRSF4Q08170 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SRSF4Q08170 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SRSF4Q08170 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SRSF4Q08170 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SRSF4Q08170 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SRSF4Q08170 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SRSF4Q08170 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SRSF4Q08170 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SRSF4Q08170 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SRSF4Q08170 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SRSF4Q08170 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SRSF4Q08170 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SRSF4Q08170 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SRSF4Q08170 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SRSF4Q08170 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SRSF4Q08170 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SRSF4Q08170 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SRSF4Q08170 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SRSF4Q08170 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SRSF4Q08170 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SRSF4Q08170 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SRSF4Q08170 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SRSF4Q08170 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SRSF4Q08170 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SRSF4Q08170 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SRSF4Q08170 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SRSF4Q08170 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
SRSF4Q08170 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SRSF4Q08170 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SRSF4Q08170 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SRSF4Q08170 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SRSF4Q08170 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SRSF4Q08170 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SRSF4Q08170 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SRSF4Q08170 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SRSF4Q08170 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SRSF4Q08170 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SRSF4Q08170 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SRSF4Q08170 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SRSF4Q08170 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SRSF4Q08170 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SRSF4Q08170 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SRSF4Q08170 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SRSF4Q08170 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SRSF4Q08170 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SRSF4Q08170 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SRSF4Q08170 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
SRSF4Q08170 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SRSF4Q08170 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SRSF4Q08170 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SRSF4Q08170 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SRSF4Q08170 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SRSF4Q08170 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SRSF4Q08170 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SRSF4Q08170 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SRSF4Q08170 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SRSF4Q08170 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SRSF4Q08170 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SRSF4Q08170 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SRSF4Q08170 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SRSF4Q08170 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SRSF4Q08170 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SRSF4Q08170 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SRSF4Q08170 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SRSF4Q08170 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SRSF4Q08170 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SRSF4Q08170 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SRSF4Q08170 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SRSF4Q08170 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SRSF4Q08170 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SRSF4Q08170 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SRSF4Q08170 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SRSF4Q08170 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SRSF4Q08170 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
SRSF4Q08170 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SRSF4Q08170 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SRSF4Q08170 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
SRSF4Q08170 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SRSF4Q08170 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SRSF4Q08170 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SRSF4Q08170 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SRSF4Q08170 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SRSF4Q08170 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SRSF4Q08170 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SRSF4Q08170 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SRSF4Q08170 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SRSF4Q08170 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SRSF4Q08170 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SRSF4Q08170 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SRSF4Q08170 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SRSF4Q08170 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SRSF4Q08170 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SRSF4Q08170 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SRSF4Q08170 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SRSF4Q08170 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SRSF4Q08170 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SRSF4Q08170 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.1 ms