Protein–RNA interactions for Protein: Q07960

ARHGAP1, Rho GTPase-activating protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 439 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARHGAP1Q07960 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
ARHGAP1Q07960 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
ARHGAP1Q07960 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
ARHGAP1Q07960 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
ARHGAP1Q07960 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC24.58■■□□□ 1.53
ARHGAP1Q07960 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
ARHGAP1Q07960 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
ARHGAP1Q07960 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.52
ARHGAP1Q07960 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC24.58■■□□□ 1.52
ARHGAP1Q07960 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
ARHGAP1Q07960 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
ARHGAP1Q07960 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC24.57■■□□□ 1.52
ARHGAP1Q07960 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
ARHGAP1Q07960 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC24.57■■□□□ 1.52
ARHGAP1Q07960 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
ARHGAP1Q07960 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
ARHGAP1Q07960 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
ARHGAP1Q07960 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
ARHGAP1Q07960 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
ARHGAP1Q07960 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
ARHGAP1Q07960 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC24.56■■□□□ 1.52
ARHGAP1Q07960 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
ARHGAP1Q07960 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
ARHGAP1Q07960 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
ARHGAP1Q07960 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
ARHGAP1Q07960 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
ARHGAP1Q07960 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
ARHGAP1Q07960 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
ARHGAP1Q07960 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
ARHGAP1Q07960 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
ARHGAP1Q07960 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
ARHGAP1Q07960 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
ARHGAP1Q07960 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
ARHGAP1Q07960 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
ARHGAP1Q07960 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
ARHGAP1Q07960 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
ARHGAP1Q07960 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
ARHGAP1Q07960 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
ARHGAP1Q07960 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
ARHGAP1Q07960 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
ARHGAP1Q07960 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC24.54■■□□□ 1.52
ARHGAP1Q07960 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
ARHGAP1Q07960 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
ARHGAP1Q07960 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
ARHGAP1Q07960 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
ARHGAP1Q07960 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
ARHGAP1Q07960 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
ARHGAP1Q07960 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
ARHGAP1Q07960 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
ARHGAP1Q07960 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
ARHGAP1Q07960 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
ARHGAP1Q07960 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
ARHGAP1Q07960 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
ARHGAP1Q07960 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
ARHGAP1Q07960 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
ARHGAP1Q07960 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
ARHGAP1Q07960 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
ARHGAP1Q07960 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
ARHGAP1Q07960 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
ARHGAP1Q07960 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
ARHGAP1Q07960 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
ARHGAP1Q07960 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
ARHGAP1Q07960 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
ARHGAP1Q07960 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
ARHGAP1Q07960 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
ARHGAP1Q07960 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
ARHGAP1Q07960 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
ARHGAP1Q07960 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
ARHGAP1Q07960 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
ARHGAP1Q07960 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
ARHGAP1Q07960 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
ARHGAP1Q07960 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
ARHGAP1Q07960 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
ARHGAP1Q07960 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
ARHGAP1Q07960 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
ARHGAP1Q07960 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
ARHGAP1Q07960 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC24.5■■□□□ 1.51
ARHGAP1Q07960 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
ARHGAP1Q07960 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
ARHGAP1Q07960 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
ARHGAP1Q07960 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
ARHGAP1Q07960 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
ARHGAP1Q07960 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
ARHGAP1Q07960 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
ARHGAP1Q07960 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
ARHGAP1Q07960 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
ARHGAP1Q07960 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
ARHGAP1Q07960 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
ARHGAP1Q07960 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
ARHGAP1Q07960 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
ARHGAP1Q07960 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
ARHGAP1Q07960 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
ARHGAP1Q07960 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
ARHGAP1Q07960 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
ARHGAP1Q07960 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
ARHGAP1Q07960 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
ARHGAP1Q07960 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
ARHGAP1Q07960 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
ARHGAP1Q07960 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
ARHGAP1Q07960 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29 ms