Protein–RNA interactions for Protein: Q07699

SCN1B, Sodium channel subunit beta-1, humanhuman

Predictions only

Length 218 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCN1BQ07699 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.4■□□□□ 0.7
SCN1BQ07699 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
SCN1BQ07699 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
SCN1BQ07699 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC19.4■□□□□ 0.7
SCN1BQ07699 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
SCN1BQ07699 ROR1-201ENST00000371079 5832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
SCN1BQ07699 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
SCN1BQ07699 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
SCN1BQ07699 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.4■□□□□ 0.7
SCN1BQ07699 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
SCN1BQ07699 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
SCN1BQ07699 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
SCN1BQ07699 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
SCN1BQ07699 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
SCN1BQ07699 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
SCN1BQ07699 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
SCN1BQ07699 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
SCN1BQ07699 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.7
SCN1BQ07699 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.7
SCN1BQ07699 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.7
SCN1BQ07699 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.7
SCN1BQ07699 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.7
SCN1BQ07699 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
SCN1BQ07699 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
SCN1BQ07699 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC19.39■□□□□ 0.69
SCN1BQ07699 RIMBP3C-202ENST00000433039 5784 ntAPPRIS P2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
SCN1BQ07699 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
SCN1BQ07699 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC19.39■□□□□ 0.69
SCN1BQ07699 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
SCN1BQ07699 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
SCN1BQ07699 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
SCN1BQ07699 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
SCN1BQ07699 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
SCN1BQ07699 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
SCN1BQ07699 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
SCN1BQ07699 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
SCN1BQ07699 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
SCN1BQ07699 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
SCN1BQ07699 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
SCN1BQ07699 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
SCN1BQ07699 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
SCN1BQ07699 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
SCN1BQ07699 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
SCN1BQ07699 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
SCN1BQ07699 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
SCN1BQ07699 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC19.38■□□□□ 0.69
SCN1BQ07699 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
SCN1BQ07699 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC19.38■□□□□ 0.69
SCN1BQ07699 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
SCN1BQ07699 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
SCN1BQ07699 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
SCN1BQ07699 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
SCN1BQ07699 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
SCN1BQ07699 OBSL1-204ENST00000404537 5841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
SCN1BQ07699 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
SCN1BQ07699 FAM83H-201ENST00000388913 5654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
SCN1BQ07699 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
SCN1BQ07699 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
SCN1BQ07699 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
SCN1BQ07699 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
SCN1BQ07699 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
SCN1BQ07699 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
SCN1BQ07699 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
SCN1BQ07699 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
SCN1BQ07699 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
SCN1BQ07699 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
SCN1BQ07699 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
SCN1BQ07699 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
SCN1BQ07699 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
SCN1BQ07699 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
SCN1BQ07699 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
SCN1BQ07699 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
SCN1BQ07699 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
SCN1BQ07699 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC19.36■□□□□ 0.69
SCN1BQ07699 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
SCN1BQ07699 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
SCN1BQ07699 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
SCN1BQ07699 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
SCN1BQ07699 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
SCN1BQ07699 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
SCN1BQ07699 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
SCN1BQ07699 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
SCN1BQ07699 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
SCN1BQ07699 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
SCN1BQ07699 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
SCN1BQ07699 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
SCN1BQ07699 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC19.35■□□□□ 0.69
SCN1BQ07699 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC19.35■□□□□ 0.69
SCN1BQ07699 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
SCN1BQ07699 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
SCN1BQ07699 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
SCN1BQ07699 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
SCN1BQ07699 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
SCN1BQ07699 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
SCN1BQ07699 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
SCN1BQ07699 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
SCN1BQ07699 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
SCN1BQ07699 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
SCN1BQ07699 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
SCN1BQ07699 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.7 ms