Protein–RNA interactions for Protein: Q07654

TFF3, Trefoil factor 3, humanhuman

Predictions only

Length 80 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TFF3Q07654 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
TFF3Q07654 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
TFF3Q07654 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
TFF3Q07654 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
TFF3Q07654 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
TFF3Q07654 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
TFF3Q07654 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
TFF3Q07654 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
TFF3Q07654 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
TFF3Q07654 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
TFF3Q07654 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
TFF3Q07654 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
TFF3Q07654 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
TFF3Q07654 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
TFF3Q07654 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
TFF3Q07654 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
TFF3Q07654 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
TFF3Q07654 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
TFF3Q07654 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
TFF3Q07654 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
TFF3Q07654 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
TFF3Q07654 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC19.28■□□□□ 0.68
TFF3Q07654 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
TFF3Q07654 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
TFF3Q07654 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
TFF3Q07654 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
TFF3Q07654 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
TFF3Q07654 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
TFF3Q07654 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
TFF3Q07654 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
TFF3Q07654 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
TFF3Q07654 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
TFF3Q07654 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC19.28■□□□□ 0.68
TFF3Q07654 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
TFF3Q07654 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
TFF3Q07654 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
TFF3Q07654 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC19.28■□□□□ 0.68
TFF3Q07654 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
TFF3Q07654 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
TFF3Q07654 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
TFF3Q07654 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
TFF3Q07654 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
TFF3Q07654 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
TFF3Q07654 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
TFF3Q07654 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
TFF3Q07654 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
TFF3Q07654 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
TFF3Q07654 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
TFF3Q07654 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
TFF3Q07654 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
TFF3Q07654 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
TFF3Q07654 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
TFF3Q07654 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.67
TFF3Q07654 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
TFF3Q07654 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
TFF3Q07654 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC19.26■□□□□ 0.67
TFF3Q07654 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
TFF3Q07654 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
TFF3Q07654 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
TFF3Q07654 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
TFF3Q07654 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
TFF3Q07654 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC19.26■□□□□ 0.67
TFF3Q07654 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
TFF3Q07654 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
TFF3Q07654 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
TFF3Q07654 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
TFF3Q07654 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
TFF3Q07654 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
TFF3Q07654 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
TFF3Q07654 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
TFF3Q07654 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
TFF3Q07654 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
TFF3Q07654 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
TFF3Q07654 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
TFF3Q07654 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
TFF3Q07654 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
TFF3Q07654 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
TFF3Q07654 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
TFF3Q07654 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
TFF3Q07654 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
TFF3Q07654 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC19.25■□□□□ 0.67
TFF3Q07654 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC19.25■□□□□ 0.67
TFF3Q07654 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
TFF3Q07654 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
TFF3Q07654 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC19.25■□□□□ 0.67
TFF3Q07654 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC19.25■□□□□ 0.67
TFF3Q07654 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
TFF3Q07654 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
TFF3Q07654 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
TFF3Q07654 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
TFF3Q07654 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
TFF3Q07654 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
TFF3Q07654 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
TFF3Q07654 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
TFF3Q07654 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
TFF3Q07654 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
TFF3Q07654 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
TFF3Q07654 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
TFF3Q07654 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
TFF3Q07654 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.4 ms