Protein–RNA interactions for Protein: Q07343

PDE4B, cAMP-specific 3',5'-cyclic phosphodiesterase 4B, humanhuman

Predictions only

Length 736 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE4BQ07343 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
PDE4BQ07343 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
PDE4BQ07343 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
PDE4BQ07343 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
PDE4BQ07343 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
PDE4BQ07343 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
PDE4BQ07343 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
PDE4BQ07343 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
PDE4BQ07343 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
PDE4BQ07343 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC25.93■■□□□ 1.74
PDE4BQ07343 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
PDE4BQ07343 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
PDE4BQ07343 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC25.93■■□□□ 1.74
PDE4BQ07343 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
PDE4BQ07343 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
PDE4BQ07343 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
PDE4BQ07343 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
PDE4BQ07343 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
PDE4BQ07343 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
PDE4BQ07343 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC25.92■■□□□ 1.74
PDE4BQ07343 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC25.92■■□□□ 1.74
PDE4BQ07343 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
PDE4BQ07343 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
PDE4BQ07343 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
PDE4BQ07343 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
PDE4BQ07343 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
PDE4BQ07343 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
PDE4BQ07343 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
PDE4BQ07343 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
PDE4BQ07343 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
PDE4BQ07343 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
PDE4BQ07343 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
PDE4BQ07343 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
PDE4BQ07343 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
PDE4BQ07343 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
PDE4BQ07343 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
PDE4BQ07343 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
PDE4BQ07343 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
PDE4BQ07343 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC25.91■■□□□ 1.74
PDE4BQ07343 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
PDE4BQ07343 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
PDE4BQ07343 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
PDE4BQ07343 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC25.91■■□□□ 1.74
PDE4BQ07343 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC25.91■■□□□ 1.74
PDE4BQ07343 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC25.91■■□□□ 1.74
PDE4BQ07343 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
PDE4BQ07343 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
PDE4BQ07343 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC25.91■■□□□ 1.74
PDE4BQ07343 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
PDE4BQ07343 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
PDE4BQ07343 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
PDE4BQ07343 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
PDE4BQ07343 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
PDE4BQ07343 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC25.9■■□□□ 1.74
PDE4BQ07343 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
PDE4BQ07343 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
PDE4BQ07343 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC25.9■■□□□ 1.74
PDE4BQ07343 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
PDE4BQ07343 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
PDE4BQ07343 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
PDE4BQ07343 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
PDE4BQ07343 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
PDE4BQ07343 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
PDE4BQ07343 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
PDE4BQ07343 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
PDE4BQ07343 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC25.89■■□□□ 1.74
PDE4BQ07343 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC25.89■■□□□ 1.74
PDE4BQ07343 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
PDE4BQ07343 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
PDE4BQ07343 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
PDE4BQ07343 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.73
PDE4BQ07343 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
PDE4BQ07343 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
PDE4BQ07343 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
PDE4BQ07343 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
PDE4BQ07343 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
PDE4BQ07343 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
PDE4BQ07343 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
PDE4BQ07343 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
PDE4BQ07343 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
PDE4BQ07343 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
PDE4BQ07343 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
PDE4BQ07343 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC25.88■■□□□ 1.73
PDE4BQ07343 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
PDE4BQ07343 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
PDE4BQ07343 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
PDE4BQ07343 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
PDE4BQ07343 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
PDE4BQ07343 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
PDE4BQ07343 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
PDE4BQ07343 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
PDE4BQ07343 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
PDE4BQ07343 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
PDE4BQ07343 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
PDE4BQ07343 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
PDE4BQ07343 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
PDE4BQ07343 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
PDE4BQ07343 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
PDE4BQ07343 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
PDE4BQ07343 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.3 ms