Protein–RNA interactions for Protein: Q04670

TY1B-MR2, Transposon Ty1-MR2 Gag-Pol polyprotein, yeastyeast

Known RBP Predictions only

Length 1,755 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
TY1B-MR2Q04670 GCN5YGR252W 1320 nt4.52□□□□□ -1.69
TY1B-MR2Q04670 DAN4YJR151C 3486 nt4.52□□□□□ -1.69
TY1B-MR2Q04670 YIL169CYIL169C 2988 nt4.52□□□□□ -1.69
TY1B-MR2Q04670 NIS1YNL078W 1224 nt4.52□□□□□ -1.69
TY1B-MR2Q04670 TAF1YGR274C 3201 nt4.52□□□□□ -1.69
TY1B-MR2Q04670 GAS4YOL132W 1416 nt4.51□□□□□ -1.69
TY1B-MR2Q04670 CAX4YGR036C 720 nt4.51□□□□□ -1.69
TY1B-MR2Q04670 DIB1YPR082C 432 nt4.51□□□□□ -1.69
TY1B-MR2Q04670 PRP28YDR243C 1767 nt4.51□□□□□ -1.69
TY1B-MR2Q04670 NNK1YKL171W 2787 nt4.51□□□□□ -1.69
TY1B-MR2Q04670 YPK9YOR291W 4419 nt4.51□□□□□ -1.69
TY1B-MR2Q04670 RDI1YDL135C 609 nt4.5□□□□□ -1.69
TY1B-MR2Q04670 GUS1YGL245W 2127 nt4.5□□□□□ -1.69
TY1B-MR2Q04670 FZF1YGL254W 900 nt4.5□□□□□ -1.69
TY1B-MR2Q04670 ARO9YHR137W 1542 nt4.5□□□□□ -1.69
TY1B-MR2Q04670 HEH2YDR458C 1992 nt4.5□□□□□ -1.69
TY1B-MR2Q04670 YDR396WYDR396W 501 nt4.5□□□□□ -1.69
TY1B-MR2Q04670 YER134CYER134C 537 nt4.5□□□□□ -1.69
TY1B-MR2Q04670 PAU23YLR037C 375 nt4.5□□□□□ -1.69
TY1B-MR2Q04670 DDC1YPL194W 1839 nt4.5□□□□□ -1.69
TY1B-MR2Q04670 GUF1YLR289W 1938 nt4.5□□□□□ -1.69
TY1B-MR2Q04670 CMR1YDL156W 1569 nt4.49□□□□□ -1.69
TY1B-MR2Q04670 ZDS1YMR273C 2748 nt4.49□□□□□ -1.69
TY1B-MR2Q04670 YER084WYER084W 387 nt4.49□□□□□ -1.69
TY1B-MR2Q04670 YPL276WYPL276W 438 nt4.49□□□□□ -1.69
TY1B-MR2Q04670 YPS6YIR039C 1614 nt4.49□□□□□ -1.69
TY1B-MR2Q04670 YOL107WYOL107W 1029 nt4.48□□□□□ -1.69
TY1B-MR2Q04670 GRE1YPL223C 507 nt4.48□□□□□ -1.69
TY1B-MR2Q04670 STV1YMR054W 2673 nt4.48□□□□□ -1.69
TY1B-MR2Q04670 RPS21AYKR057W 264 nt4.48□□□□□ -1.69
TY1B-MR2Q04670 NAM2YLR382C 2685 nt4.47□□□□□ -1.69
TY1B-MR2Q04670 YHR069C-AYHR069C-A 363 nt4.47□□□□□ -1.69
TY1B-MR2Q04670 YAL031W-AYAL031W-A 309 nt4.47□□□□□ -1.69
TY1B-MR2Q04670 YPR136CYPR136C 513 nt4.47□□□□□ -1.69
TY1B-MR2Q04670 BLM10YFL007W 6432 nt4.47□□□□□ -1.69
TY1B-MR2Q04670 VTC4YJL012C 2166 nt4.46□□□□□ -1.69
TY1B-MR2Q04670 CDC14YFR028C 1656 nt4.46□□□□□ -1.7
TY1B-MR2Q04670 PEX18YHR160C 852 nt4.46□□□□□ -1.7
TY1B-MR2Q04670 YML037CYML037C 1023 nt4.46□□□□□ -1.7
TY1B-MR2Q04670 MSN1YOL116W 1149 nt4.46□□□□□ -1.7
TY1B-MR2Q04670 CHA4YLR098C 1947 nt4.46□□□□□ -1.7
TY1B-MR2Q04670 YLR001CYLR001C 2589 nt4.45□□□□□ -1.7
TY1B-MR2Q04670 YOR022CYOR022C 2148 nt4.45□□□□□ -1.7
TY1B-MR2Q04670 SPT23YKL020C 3249 nt4.45□□□□□ -1.7
TY1B-MR2Q04670 SIR1YKR101W 1965 nt4.45□□□□□ -1.7
TY1B-MR2Q04670 TOM7YNL070W 183 nt4.45□□□□□ -1.7
TY1B-MR2Q04670 PDR3YBL005W 2931 nt4.44□□□□□ -1.7
TY1B-MR2Q04670 ATG2YNL242W 4779 nt4.44□□□□□ -1.7
TY1B-MR2Q04670 ESF1YDR365C 1887 nt4.44□□□□□ -1.7
TY1B-MR2Q04670 YIL175WYIL175W 318 nt4.44□□□□□ -1.7
TY1B-MR2Q04670 YJL222W-BYJL222W-B 138 nt4.44□□□□□ -1.7
TY1B-MR2Q04670 PRX1YBL064C 786 nt4.44□□□□□ -1.7
TY1B-MR2Q04670 GPI18YBR004C 1302 nt4.44□□□□□ -1.7
TY1B-MR2Q04670 SPT6YGR116W 4356 nt4.44□□□□□ -1.7
TY1B-MR2Q04670 XRN1YGL173C 4587 nt4.43□□□□□ -1.7
TY1B-MR2Q04670 RPS11AYDR025W 471 nt4.43□□□□□ -1.7
TY1B-MR2Q04670 YDR526CYDR526C 471 nt4.43□□□□□ -1.7
TY1B-MR2Q04670 VAC7YNL054W 3498 nt4.43□□□□□ -1.7
TY1B-MR2Q04670 ILS1YBL076C 3219 nt4.43□□□□□ -1.7
TY1B-MR2Q04670 RGC1YPR115W 3252 nt4.43□□□□□ -1.7
TY1B-MR2Q04670 ERP6YGL002W 651 nt4.42□□□□□ -1.7
TY1B-MR2Q04670 YLR297WYLR297W 390 nt4.42□□□□□ -1.7
TY1B-MR2Q04670 CBP3YPL215W 1008 nt4.42□□□□□ -1.7
TY1B-MR2Q04670 PEX32YBR168W 1242 nt4.42□□□□□ -1.7
TY1B-MR2Q04670 YPL109CYPL109C 1974 nt4.42□□□□□ -1.7
TY1B-MR2Q04670 YKL107WYKL107W 930 nt4.42□□□□□ -1.7
TY1B-MR2Q04670 SRP40YKR092C 1221 nt4.42□□□□□ -1.7
TY1B-MR2Q04670 snR43snR43 209 nt4.42□□□□□ -1.7
TY1B-MR2Q04670 PAM18YLR008C 507 nt4.4□□□□□ -1.7
TY1B-MR2Q04670 CCW14YLR390W-A 717 nt4.4□□□□□ -1.7
TY1B-MR2Q04670 CSM3YMR048W 954 nt4.4□□□□□ -1.7
TY1B-MR2Q04670 RDL2YOR286W 450 nt4.4□□□□□ -1.7
TY1B-MR2Q04670 FKH1YIL131C 1455 nt4.4□□□□□ -1.7
TY1B-MR2Q04670 PRS5YOL061W 1491 nt4.4□□□□□ -1.7
TY1B-MR2Q04670 RNR2YJL026W 1200 nt4.4□□□□□ -1.71
TY1B-MR2Q04670 MMR1YLR190W 1476 nt4.4□□□□□ -1.71
TY1B-MR2Q04670 TUM1YOR251C 915 nt4.4□□□□□ -1.71
TY1B-MR2Q04670 TMA108YIL137C 2841 nt4.39□□□□□ -1.71
TY1B-MR2Q04670 YPL150WYPL150W 2706 nt4.39□□□□□ -1.71
TY1B-MR2Q04670 YDL180WYDL180W 1644 nt4.39□□□□□ -1.71
TY1B-MR2Q04670 SMC6YLR383W 3345 nt4.39□□□□□ -1.71
TY1B-MR2Q04670 WTM2YOR229W 1404 nt4.38□□□□□ -1.71
TY1B-MR2Q04670 ABD1YBR236C 1311 nt4.38□□□□□ -1.71
TY1B-MR2Q04670 IDP2YLR174W 1239 nt4.38□□□□□ -1.71
TY1B-MR2Q04670 TFB2YPL122C 1542 nt4.38□□□□□ -1.71
TY1B-MR2Q04670 ARP4YJL081C 1470 nt4.38□□□□□ -1.71
TY1B-MR2Q04670 ATP4YPL078C 735 nt4.37□□□□□ -1.71
TY1B-MR2Q04670 AFT1YGL071W 2073 nt4.37□□□□□ -1.71
TY1B-MR2Q04670 BCP1YDR361C 852 nt4.37□□□□□ -1.71
TY1B-MR2Q04670 CWH41YGL027C 2502 nt4.37□□□□□ -1.71
TY1B-MR2Q04670 RSM24YDR175C 960 nt4.36□□□□□ -1.71
TY1B-MR2Q04670 VEL1YGL258W 621 nt4.36□□□□□ -1.71
TY1B-MR2Q04670 SHH3YMR118C 591 nt4.36□□□□□ -1.71
TY1B-MR2Q04670 GUP1YGL084C 1683 nt4.36□□□□□ -1.71
TY1B-MR2Q04670 KTR7YIL085C 1554 nt4.36□□□□□ -1.71
TY1B-MR2Q04670 SOH1YGL127C 384 nt4.35□□□□□ -1.71
TY1B-MR2Q04670 YHR052W-AYHR052W-A 195 nt4.35□□□□□ -1.71
TY1B-MR2Q04670 YHR054W-AYHR054W-A 195 nt4.35□□□□□ -1.71
TY1B-MR2Q04670 DCS1YLR270W 1053 nt4.35□□□□□ -1.71
TY1B-MR2Q04670 AIM25YJR100C 984 nt4.35□□□□□ -1.71
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 19 ms