Protein–RNA interactions for Protein: Q03395

ROM1, Rod outer segment membrane protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 351 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ROM1Q03395 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
ROM1Q03395 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
ROM1Q03395 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
ROM1Q03395 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
ROM1Q03395 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
ROM1Q03395 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC19.21■□□□□ 0.67
ROM1Q03395 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
ROM1Q03395 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
ROM1Q03395 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
ROM1Q03395 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
ROM1Q03395 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
ROM1Q03395 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
ROM1Q03395 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
ROM1Q03395 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC19.21■□□□□ 0.67
ROM1Q03395 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
ROM1Q03395 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
ROM1Q03395 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.66
ROM1Q03395 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
ROM1Q03395 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
ROM1Q03395 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
ROM1Q03395 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
ROM1Q03395 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
ROM1Q03395 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
ROM1Q03395 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
ROM1Q03395 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
ROM1Q03395 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
ROM1Q03395 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
ROM1Q03395 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
ROM1Q03395 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
ROM1Q03395 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
ROM1Q03395 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC19.19■□□□□ 0.66
ROM1Q03395 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
ROM1Q03395 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
ROM1Q03395 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
ROM1Q03395 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
ROM1Q03395 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
ROM1Q03395 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
ROM1Q03395 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
ROM1Q03395 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC19.18■□□□□ 0.66
ROM1Q03395 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
ROM1Q03395 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
ROM1Q03395 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
ROM1Q03395 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
ROM1Q03395 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
ROM1Q03395 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
ROM1Q03395 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
ROM1Q03395 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
ROM1Q03395 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
ROM1Q03395 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
ROM1Q03395 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
ROM1Q03395 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
ROM1Q03395 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
ROM1Q03395 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
ROM1Q03395 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
ROM1Q03395 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
ROM1Q03395 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
ROM1Q03395 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
ROM1Q03395 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
ROM1Q03395 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
ROM1Q03395 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
ROM1Q03395 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
ROM1Q03395 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
ROM1Q03395 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
ROM1Q03395 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
ROM1Q03395 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
ROM1Q03395 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
ROM1Q03395 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
ROM1Q03395 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
ROM1Q03395 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
ROM1Q03395 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
ROM1Q03395 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
ROM1Q03395 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
ROM1Q03395 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
ROM1Q03395 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
ROM1Q03395 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
ROM1Q03395 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
ROM1Q03395 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
ROM1Q03395 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
ROM1Q03395 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
ROM1Q03395 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
ROM1Q03395 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
ROM1Q03395 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
ROM1Q03395 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
ROM1Q03395 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
ROM1Q03395 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
ROM1Q03395 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
ROM1Q03395 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
ROM1Q03395 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
ROM1Q03395 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
ROM1Q03395 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
ROM1Q03395 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
ROM1Q03395 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
ROM1Q03395 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
ROM1Q03395 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
ROM1Q03395 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
ROM1Q03395 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
ROM1Q03395 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
ROM1Q03395 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
ROM1Q03395 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
ROM1Q03395 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.8 ms