Protein–RNA interactions for Protein: Q03188

CENPC, Centromere protein C, humanhuman

Predictions only

Length 943 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPCQ03188 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CENPCQ03188 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CENPCQ03188 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CENPCQ03188 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CENPCQ03188 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CENPCQ03188 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CENPCQ03188 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CENPCQ03188 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CENPCQ03188 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CENPCQ03188 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CENPCQ03188 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CENPCQ03188 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CENPCQ03188 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CENPCQ03188 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CENPCQ03188 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CENPCQ03188 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CENPCQ03188 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CENPCQ03188 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CENPCQ03188 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CENPCQ03188 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CENPCQ03188 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CENPCQ03188 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CENPCQ03188 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CENPCQ03188 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CENPCQ03188 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CENPCQ03188 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CENPCQ03188 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CENPCQ03188 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CENPCQ03188 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CENPCQ03188 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CENPCQ03188 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CENPCQ03188 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
CENPCQ03188 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
CENPCQ03188 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CENPCQ03188 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CENPCQ03188 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CENPCQ03188 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CENPCQ03188 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
CENPCQ03188 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CENPCQ03188 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CENPCQ03188 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
CENPCQ03188 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CENPCQ03188 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CENPCQ03188 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CENPCQ03188 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CENPCQ03188 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CENPCQ03188 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CENPCQ03188 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CENPCQ03188 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CENPCQ03188 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CENPCQ03188 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CENPCQ03188 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CENPCQ03188 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CENPCQ03188 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CENPCQ03188 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CENPCQ03188 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CENPCQ03188 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CENPCQ03188 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CENPCQ03188 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CENPCQ03188 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CENPCQ03188 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CENPCQ03188 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CENPCQ03188 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CENPCQ03188 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CENPCQ03188 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CENPCQ03188 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CENPCQ03188 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CENPCQ03188 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CENPCQ03188 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CENPCQ03188 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CENPCQ03188 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
CENPCQ03188 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CENPCQ03188 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CENPCQ03188 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CENPCQ03188 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CENPCQ03188 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CENPCQ03188 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CENPCQ03188 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CENPCQ03188 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CENPCQ03188 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CENPCQ03188 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
CENPCQ03188 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CENPCQ03188 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CENPCQ03188 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CENPCQ03188 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CENPCQ03188 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CENPCQ03188 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CENPCQ03188 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CENPCQ03188 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CENPCQ03188 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CENPCQ03188 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CENPCQ03188 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CENPCQ03188 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CENPCQ03188 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CENPCQ03188 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CENPCQ03188 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CENPCQ03188 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CENPCQ03188 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CENPCQ03188 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CENPCQ03188 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.9 ms