Protein–RNA interactions for Protein: Q00889

PSG6, Pregnancy-specific beta-1-glycoprotein 6, humanhuman

Predictions only

Length 435 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSG6Q00889 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
PSG6Q00889 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
PSG6Q00889 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
PSG6Q00889 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
PSG6Q00889 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
PSG6Q00889 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
PSG6Q00889 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
PSG6Q00889 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
PSG6Q00889 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
PSG6Q00889 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
PSG6Q00889 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
PSG6Q00889 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
PSG6Q00889 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
PSG6Q00889 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
PSG6Q00889 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
PSG6Q00889 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
PSG6Q00889 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
PSG6Q00889 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
PSG6Q00889 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
PSG6Q00889 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC20.29■□□□□ 0.84
PSG6Q00889 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
PSG6Q00889 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
PSG6Q00889 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
PSG6Q00889 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
PSG6Q00889 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
PSG6Q00889 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC20.28■□□□□ 0.84
PSG6Q00889 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
PSG6Q00889 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
PSG6Q00889 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
PSG6Q00889 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
PSG6Q00889 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
PSG6Q00889 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
PSG6Q00889 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
PSG6Q00889 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
PSG6Q00889 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
PSG6Q00889 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
PSG6Q00889 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
PSG6Q00889 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.84
PSG6Q00889 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
PSG6Q00889 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
PSG6Q00889 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
PSG6Q00889 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
PSG6Q00889 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.27■□□□□ 0.84
PSG6Q00889 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
PSG6Q00889 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
PSG6Q00889 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.84
PSG6Q00889 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
PSG6Q00889 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
PSG6Q00889 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.83
PSG6Q00889 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
PSG6Q00889 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
PSG6Q00889 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
PSG6Q00889 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
PSG6Q00889 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
PSG6Q00889 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
PSG6Q00889 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
PSG6Q00889 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
PSG6Q00889 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
PSG6Q00889 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
PSG6Q00889 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
PSG6Q00889 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
PSG6Q00889 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
PSG6Q00889 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
PSG6Q00889 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
PSG6Q00889 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
PSG6Q00889 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
PSG6Q00889 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
PSG6Q00889 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
PSG6Q00889 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
PSG6Q00889 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
PSG6Q00889 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
PSG6Q00889 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
PSG6Q00889 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
PSG6Q00889 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
PSG6Q00889 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
PSG6Q00889 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
PSG6Q00889 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
PSG6Q00889 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
PSG6Q00889 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
PSG6Q00889 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
PSG6Q00889 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
PSG6Q00889 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
PSG6Q00889 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
PSG6Q00889 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
PSG6Q00889 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
PSG6Q00889 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
PSG6Q00889 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
PSG6Q00889 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
PSG6Q00889 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
PSG6Q00889 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
PSG6Q00889 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
PSG6Q00889 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
PSG6Q00889 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
PSG6Q00889 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
PSG6Q00889 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
PSG6Q00889 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
PSG6Q00889 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
PSG6Q00889 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC20.24■□□□□ 0.83
PSG6Q00889 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
PSG6Q00889 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.8 ms