Protein–RNA interactions for Protein: P98177

FOXO4, Forkhead box protein O4, humanhuman

Predictions only

Length 505 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXO4P98177 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
FOXO4P98177 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
FOXO4P98177 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
FOXO4P98177 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
FOXO4P98177 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
FOXO4P98177 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
FOXO4P98177 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
FOXO4P98177 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
FOXO4P98177 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
FOXO4P98177 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
FOXO4P98177 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
FOXO4P98177 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC27.28■■□□□ 1.96
FOXO4P98177 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
FOXO4P98177 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.28■■□□□ 1.96
FOXO4P98177 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC27.28■■□□□ 1.96
FOXO4P98177 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
FOXO4P98177 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
FOXO4P98177 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
FOXO4P98177 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC27.28■■□□□ 1.96
FOXO4P98177 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC27.28■■□□□ 1.96
FOXO4P98177 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
FOXO4P98177 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
FOXO4P98177 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
FOXO4P98177 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
FOXO4P98177 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
FOXO4P98177 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
FOXO4P98177 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
FOXO4P98177 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.96
FOXO4P98177 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.96
FOXO4P98177 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC27.26■■□□□ 1.95
FOXO4P98177 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC27.26■■□□□ 1.95
FOXO4P98177 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
FOXO4P98177 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
FOXO4P98177 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC27.26■■□□□ 1.95
FOXO4P98177 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
FOXO4P98177 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
FOXO4P98177 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
FOXO4P98177 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC27.26■■□□□ 1.95
FOXO4P98177 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
FOXO4P98177 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
FOXO4P98177 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
FOXO4P98177 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
FOXO4P98177 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
FOXO4P98177 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
FOXO4P98177 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
FOXO4P98177 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
FOXO4P98177 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
FOXO4P98177 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC27.25■■□□□ 1.95
FOXO4P98177 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC27.25■■□□□ 1.95
FOXO4P98177 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC27.25■■□□□ 1.95
FOXO4P98177 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC27.25■■□□□ 1.95
FOXO4P98177 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
FOXO4P98177 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
FOXO4P98177 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
FOXO4P98177 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
FOXO4P98177 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
FOXO4P98177 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
FOXO4P98177 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
FOXO4P98177 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
FOXO4P98177 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
FOXO4P98177 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
FOXO4P98177 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
FOXO4P98177 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
FOXO4P98177 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
FOXO4P98177 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
FOXO4P98177 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
FOXO4P98177 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
FOXO4P98177 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
FOXO4P98177 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
FOXO4P98177 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
FOXO4P98177 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC27.22■■□□□ 1.95
FOXO4P98177 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
FOXO4P98177 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
FOXO4P98177 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC27.22■■□□□ 1.95
FOXO4P98177 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
FOXO4P98177 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
FOXO4P98177 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC27.22■■□□□ 1.95
FOXO4P98177 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC27.22■■□□□ 1.95
FOXO4P98177 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
FOXO4P98177 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
FOXO4P98177 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
FOXO4P98177 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
FOXO4P98177 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
FOXO4P98177 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
FOXO4P98177 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
FOXO4P98177 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.21■■□□□ 1.95
FOXO4P98177 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
FOXO4P98177 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC27.21■■□□□ 1.95
FOXO4P98177 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
FOXO4P98177 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
FOXO4P98177 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
FOXO4P98177 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.94
FOXO4P98177 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
FOXO4P98177 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
FOXO4P98177 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC27.2■■□□□ 1.94
FOXO4P98177 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
FOXO4P98177 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
FOXO4P98177 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.94
FOXO4P98177 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC27.2■■□□□ 1.94
FOXO4P98177 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.4 ms