Protein–RNA interactions for Protein: P98174

FGD1, FYVE, RhoGEF and PH domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 961 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FGD1P98174 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
FGD1P98174 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
FGD1P98174 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
FGD1P98174 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC26.05■■□□□ 1.76
FGD1P98174 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
FGD1P98174 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
FGD1P98174 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
FGD1P98174 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
FGD1P98174 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
FGD1P98174 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
FGD1P98174 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
FGD1P98174 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
FGD1P98174 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
FGD1P98174 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
FGD1P98174 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
FGD1P98174 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
FGD1P98174 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
FGD1P98174 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
FGD1P98174 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
FGD1P98174 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
FGD1P98174 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
FGD1P98174 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
FGD1P98174 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
FGD1P98174 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
FGD1P98174 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
FGD1P98174 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
FGD1P98174 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
FGD1P98174 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
FGD1P98174 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
FGD1P98174 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
FGD1P98174 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
FGD1P98174 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
FGD1P98174 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
FGD1P98174 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
FGD1P98174 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
FGD1P98174 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
FGD1P98174 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
FGD1P98174 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
FGD1P98174 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
FGD1P98174 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
FGD1P98174 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
FGD1P98174 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
FGD1P98174 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
FGD1P98174 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
FGD1P98174 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
FGD1P98174 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
FGD1P98174 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
FGD1P98174 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
FGD1P98174 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC26.02■■□□□ 1.76
FGD1P98174 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
FGD1P98174 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
FGD1P98174 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
FGD1P98174 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
FGD1P98174 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
FGD1P98174 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
FGD1P98174 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
FGD1P98174 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
FGD1P98174 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
FGD1P98174 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
FGD1P98174 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
FGD1P98174 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
FGD1P98174 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
FGD1P98174 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
FGD1P98174 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
FGD1P98174 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
FGD1P98174 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC26■■□□□ 1.75
FGD1P98174 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
FGD1P98174 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
FGD1P98174 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC26■■□□□ 1.75
FGD1P98174 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
FGD1P98174 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
FGD1P98174 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC26■■□□□ 1.75
FGD1P98174 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC26■■□□□ 1.75
FGD1P98174 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
FGD1P98174 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
FGD1P98174 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
FGD1P98174 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
FGD1P98174 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
FGD1P98174 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC26■■□□□ 1.75
FGD1P98174 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
FGD1P98174 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.99■■□□□ 1.75
FGD1P98174 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
FGD1P98174 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
FGD1P98174 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
FGD1P98174 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
FGD1P98174 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
FGD1P98174 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
FGD1P98174 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC25.99■■□□□ 1.75
FGD1P98174 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
FGD1P98174 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
FGD1P98174 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
FGD1P98174 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
FGD1P98174 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
FGD1P98174 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
FGD1P98174 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
FGD1P98174 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
FGD1P98174 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
FGD1P98174 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
FGD1P98174 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
FGD1P98174 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.2 ms