Protein–RNA interactions for Protein: P98155

VLDLR, Very low-density lipoprotein receptor, humanhuman

Predictions only

Length 873 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VLDLRP98155 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
VLDLRP98155 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
VLDLRP98155 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
VLDLRP98155 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
VLDLRP98155 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
VLDLRP98155 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
VLDLRP98155 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
VLDLRP98155 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
VLDLRP98155 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
VLDLRP98155 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
VLDLRP98155 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC20.4■□□□□ 0.86
VLDLRP98155 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
VLDLRP98155 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
VLDLRP98155 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
VLDLRP98155 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
VLDLRP98155 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
VLDLRP98155 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
VLDLRP98155 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
VLDLRP98155 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
VLDLRP98155 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
VLDLRP98155 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
VLDLRP98155 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC20.39■□□□□ 0.85
VLDLRP98155 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
VLDLRP98155 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
VLDLRP98155 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
VLDLRP98155 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
VLDLRP98155 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
VLDLRP98155 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC20.38■□□□□ 0.85
VLDLRP98155 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
VLDLRP98155 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
VLDLRP98155 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
VLDLRP98155 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
VLDLRP98155 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
VLDLRP98155 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
VLDLRP98155 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
VLDLRP98155 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
VLDLRP98155 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
VLDLRP98155 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
VLDLRP98155 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
VLDLRP98155 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
VLDLRP98155 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
VLDLRP98155 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
VLDLRP98155 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
VLDLRP98155 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
VLDLRP98155 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
VLDLRP98155 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
VLDLRP98155 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
VLDLRP98155 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
VLDLRP98155 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
VLDLRP98155 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
VLDLRP98155 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
VLDLRP98155 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
VLDLRP98155 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
VLDLRP98155 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
VLDLRP98155 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
VLDLRP98155 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
VLDLRP98155 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
VLDLRP98155 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
VLDLRP98155 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
VLDLRP98155 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
VLDLRP98155 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
VLDLRP98155 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
VLDLRP98155 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
VLDLRP98155 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
VLDLRP98155 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
VLDLRP98155 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
VLDLRP98155 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
VLDLRP98155 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
VLDLRP98155 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
VLDLRP98155 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
VLDLRP98155 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
VLDLRP98155 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
VLDLRP98155 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
VLDLRP98155 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
VLDLRP98155 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
VLDLRP98155 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
VLDLRP98155 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
VLDLRP98155 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
VLDLRP98155 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
VLDLRP98155 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
VLDLRP98155 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
VLDLRP98155 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
VLDLRP98155 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
VLDLRP98155 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
VLDLRP98155 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
VLDLRP98155 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
VLDLRP98155 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
VLDLRP98155 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
VLDLRP98155 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
VLDLRP98155 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
VLDLRP98155 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
VLDLRP98155 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
VLDLRP98155 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
VLDLRP98155 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
VLDLRP98155 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
VLDLRP98155 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
VLDLRP98155 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
VLDLRP98155 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
VLDLRP98155 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
VLDLRP98155 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.6 ms