Protein–RNA interactions for Protein: P80303

NUCB2, Nucleobindin-2, humanhuman

Predictions only

Length 420 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUCB2P80303 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC25.63■■□□□ 1.69
NUCB2P80303 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
NUCB2P80303 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
NUCB2P80303 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
NUCB2P80303 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
NUCB2P80303 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
NUCB2P80303 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
NUCB2P80303 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
NUCB2P80303 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
NUCB2P80303 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
NUCB2P80303 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
NUCB2P80303 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
NUCB2P80303 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
NUCB2P80303 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
NUCB2P80303 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
NUCB2P80303 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
NUCB2P80303 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
NUCB2P80303 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
NUCB2P80303 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
NUCB2P80303 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
NUCB2P80303 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
NUCB2P80303 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
NUCB2P80303 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
NUCB2P80303 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
NUCB2P80303 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
NUCB2P80303 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC25.61■■□□□ 1.69
NUCB2P80303 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
NUCB2P80303 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
NUCB2P80303 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
NUCB2P80303 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
NUCB2P80303 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
NUCB2P80303 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
NUCB2P80303 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
NUCB2P80303 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
NUCB2P80303 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
NUCB2P80303 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
NUCB2P80303 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
NUCB2P80303 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
NUCB2P80303 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC25.59■■□□□ 1.69
NUCB2P80303 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
NUCB2P80303 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
NUCB2P80303 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC25.59■■□□□ 1.69
NUCB2P80303 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
NUCB2P80303 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
NUCB2P80303 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
NUCB2P80303 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
NUCB2P80303 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
NUCB2P80303 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
NUCB2P80303 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
NUCB2P80303 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
NUCB2P80303 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
NUCB2P80303 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
NUCB2P80303 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
NUCB2P80303 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
NUCB2P80303 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.68
NUCB2P80303 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.68
NUCB2P80303 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.68
NUCB2P80303 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.68
NUCB2P80303 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.68
NUCB2P80303 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
NUCB2P80303 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
NUCB2P80303 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
NUCB2P80303 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
NUCB2P80303 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
NUCB2P80303 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
NUCB2P80303 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
NUCB2P80303 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
NUCB2P80303 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
NUCB2P80303 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
NUCB2P80303 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
NUCB2P80303 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
NUCB2P80303 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
NUCB2P80303 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
NUCB2P80303 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
NUCB2P80303 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
NUCB2P80303 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
NUCB2P80303 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
NUCB2P80303 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
NUCB2P80303 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
NUCB2P80303 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
NUCB2P80303 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
NUCB2P80303 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
NUCB2P80303 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
NUCB2P80303 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
NUCB2P80303 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC25.55■■□□□ 1.68
NUCB2P80303 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
NUCB2P80303 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
NUCB2P80303 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
NUCB2P80303 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
NUCB2P80303 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
NUCB2P80303 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
NUCB2P80303 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
NUCB2P80303 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
NUCB2P80303 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
NUCB2P80303 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
NUCB2P80303 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
NUCB2P80303 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
NUCB2P80303 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
NUCB2P80303 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
NUCB2P80303 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.9 ms