Protein–RNA interactions for Protein: P80098

CCL7, C-C motif chemokine 7, humanhuman

Predictions only

Length 99 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCL7P80098 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CCL7P80098 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CCL7P80098 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CCL7P80098 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CCL7P80098 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CCL7P80098 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CCL7P80098 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CCL7P80098 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CCL7P80098 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CCL7P80098 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CCL7P80098 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CCL7P80098 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CCL7P80098 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CCL7P80098 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CCL7P80098 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
CCL7P80098 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
CCL7P80098 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
CCL7P80098 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
CCL7P80098 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
CCL7P80098 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
CCL7P80098 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
CCL7P80098 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
CCL7P80098 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
CCL7P80098 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
CCL7P80098 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
CCL7P80098 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
CCL7P80098 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC21.08■□□□□ 0.96
CCL7P80098 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CCL7P80098 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CCL7P80098 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CCL7P80098 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CCL7P80098 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CCL7P80098 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CCL7P80098 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CCL7P80098 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CCL7P80098 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
CCL7P80098 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
CCL7P80098 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
CCL7P80098 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CCL7P80098 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
CCL7P80098 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
CCL7P80098 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CCL7P80098 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CCL7P80098 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
CCL7P80098 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
CCL7P80098 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CCL7P80098 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC21.06■□□□□ 0.96
CCL7P80098 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CCL7P80098 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CCL7P80098 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC21.06■□□□□ 0.96
CCL7P80098 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
CCL7P80098 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC21.06■□□□□ 0.96
CCL7P80098 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CCL7P80098 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
CCL7P80098 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
CCL7P80098 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CCL7P80098 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CCL7P80098 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
CCL7P80098 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
CCL7P80098 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
CCL7P80098 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
CCL7P80098 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
CCL7P80098 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
CCL7P80098 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
CCL7P80098 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.04■□□□□ 0.96
CCL7P80098 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
CCL7P80098 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
CCL7P80098 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
CCL7P80098 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC21.04■□□□□ 0.96
CCL7P80098 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
CCL7P80098 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
CCL7P80098 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
CCL7P80098 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.04■□□□□ 0.96
CCL7P80098 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
CCL7P80098 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
CCL7P80098 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
CCL7P80098 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
CCL7P80098 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
CCL7P80098 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
CCL7P80098 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
CCL7P80098 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC21.03■□□□□ 0.96
CCL7P80098 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
CCL7P80098 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC21.03■□□□□ 0.96
CCL7P80098 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
CCL7P80098 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
CCL7P80098 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
CCL7P80098 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
CCL7P80098 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
CCL7P80098 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
CCL7P80098 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
CCL7P80098 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC21.02■□□□□ 0.96
CCL7P80098 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
CCL7P80098 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
CCL7P80098 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC21.02■□□□□ 0.96
CCL7P80098 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
CCL7P80098 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
CCL7P80098 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
CCL7P80098 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
CCL7P80098 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
CCL7P80098 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.4 ms