Protein–RNA interactions for Protein: P78545

ELF3, ETS-related transcription factor Elf-3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 371 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ELF3P78545 WNT7B-202ENST00000409496 2285 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
ELF3P78545 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
ELF3P78545 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
ELF3P78545 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
ELF3P78545 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
ELF3P78545 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
ELF3P78545 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
ELF3P78545 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
ELF3P78545 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
ELF3P78545 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
ELF3P78545 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
ELF3P78545 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
ELF3P78545 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
ELF3P78545 CPXM2-204ENST00000615851 2512 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
ELF3P78545 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
ELF3P78545 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
ELF3P78545 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
ELF3P78545 BAALC-203ENST00000309982 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
ELF3P78545 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
ELF3P78545 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
ELF3P78545 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
ELF3P78545 TDRP-203ENST00000523656 2622 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
ELF3P78545 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
ELF3P78545 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
ELF3P78545 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
ELF3P78545 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
ELF3P78545 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
ELF3P78545 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
ELF3P78545 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
ELF3P78545 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
ELF3P78545 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
ELF3P78545 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC21.23■□□□□ 0.99
ELF3P78545 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
ELF3P78545 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
ELF3P78545 GNS-208ENST00000543646 2164 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
ELF3P78545 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC21.23■□□□□ 0.99
ELF3P78545 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
ELF3P78545 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
ELF3P78545 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
ELF3P78545 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
ELF3P78545 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
ELF3P78545 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
ELF3P78545 IL17RE-206ENST00000454190 2757 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
ELF3P78545 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
ELF3P78545 NOP56-201ENST00000329276 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
ELF3P78545 TPD52-209ENST00000518937 2856 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
ELF3P78545 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
ELF3P78545 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
ELF3P78545 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
ELF3P78545 MCC-208ENST00000514701 2855 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
ELF3P78545 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
ELF3P78545 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
ELF3P78545 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
ELF3P78545 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
ELF3P78545 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC21.22■□□□□ 0.99
ELF3P78545 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
ELF3P78545 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
ELF3P78545 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
ELF3P78545 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
ELF3P78545 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
ELF3P78545 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
ELF3P78545 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
ELF3P78545 TMEM214-203ENST00000404032 2830 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
ELF3P78545 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
ELF3P78545 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
ELF3P78545 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
ELF3P78545 ATP6V0E2-203ENST00000456496 2722 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
ELF3P78545 ATP6V0E2-213ENST00000615196 2727 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
ELF3P78545 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
ELF3P78545 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
ELF3P78545 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
ELF3P78545 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
ELF3P78545 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
ELF3P78545 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
ELF3P78545 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
ELF3P78545 ZNF707-202ENST00000418203 2661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
ELF3P78545 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC21.2■□□□□ 0.98
ELF3P78545 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
ELF3P78545 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
ELF3P78545 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
ELF3P78545 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
ELF3P78545 AL020996.1-203ENST00000536896 2307 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
ELF3P78545 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
ELF3P78545 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
ELF3P78545 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
ELF3P78545 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
ELF3P78545 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
ELF3P78545 PDLIM3-212ENST00000620787 2352 ntTSL 4 BASIC21.2■□□□□ 0.98
ELF3P78545 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
ELF3P78545 NTRK1-206ENST00000524377 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
ELF3P78545 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
ELF3P78545 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
ELF3P78545 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
ELF3P78545 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
ELF3P78545 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
ELF3P78545 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
ELF3P78545 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
ELF3P78545 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
ELF3P78545 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
ELF3P78545 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.7 ms