Protein–RNA interactions for Protein: P63132

HERVK_113, Endogenous retrovirus group K member 113 Pol protein, humanhuman

Predictions only

Length 956 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERVK_113P63132 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
HERVK_113P63132 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
HERVK_113P63132 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
HERVK_113P63132 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
HERVK_113P63132 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
HERVK_113P63132 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
HERVK_113P63132 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
HERVK_113P63132 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
HERVK_113P63132 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
HERVK_113P63132 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
HERVK_113P63132 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
HERVK_113P63132 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
HERVK_113P63132 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
HERVK_113P63132 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
HERVK_113P63132 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
HERVK_113P63132 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
HERVK_113P63132 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
HERVK_113P63132 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
HERVK_113P63132 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
HERVK_113P63132 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
HERVK_113P63132 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
HERVK_113P63132 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
HERVK_113P63132 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
HERVK_113P63132 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
HERVK_113P63132 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
HERVK_113P63132 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
HERVK_113P63132 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
HERVK_113P63132 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
HERVK_113P63132 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
HERVK_113P63132 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
HERVK_113P63132 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
HERVK_113P63132 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
HERVK_113P63132 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
HERVK_113P63132 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
HERVK_113P63132 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
HERVK_113P63132 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
HERVK_113P63132 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
HERVK_113P63132 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
HERVK_113P63132 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
HERVK_113P63132 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
HERVK_113P63132 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
HERVK_113P63132 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC21.39■■□□□ 1.01
HERVK_113P63132 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
HERVK_113P63132 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
HERVK_113P63132 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
HERVK_113P63132 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
HERVK_113P63132 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
HERVK_113P63132 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
HERVK_113P63132 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
HERVK_113P63132 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
HERVK_113P63132 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
HERVK_113P63132 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
HERVK_113P63132 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
HERVK_113P63132 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
HERVK_113P63132 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
HERVK_113P63132 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
HERVK_113P63132 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
HERVK_113P63132 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
HERVK_113P63132 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
HERVK_113P63132 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
HERVK_113P63132 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
HERVK_113P63132 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
HERVK_113P63132 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
HERVK_113P63132 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
HERVK_113P63132 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
HERVK_113P63132 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
HERVK_113P63132 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
HERVK_113P63132 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
HERVK_113P63132 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
HERVK_113P63132 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
HERVK_113P63132 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
HERVK_113P63132 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
HERVK_113P63132 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
HERVK_113P63132 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
HERVK_113P63132 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
HERVK_113P63132 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
HERVK_113P63132 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
HERVK_113P63132 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
HERVK_113P63132 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
HERVK_113P63132 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
HERVK_113P63132 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
HERVK_113P63132 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
HERVK_113P63132 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
HERVK_113P63132 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
HERVK_113P63132 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
HERVK_113P63132 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
HERVK_113P63132 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
HERVK_113P63132 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
HERVK_113P63132 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
HERVK_113P63132 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
HERVK_113P63132 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
HERVK_113P63132 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
HERVK_113P63132 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
HERVK_113P63132 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
HERVK_113P63132 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
HERVK_113P63132 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
HERVK_113P63132 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
HERVK_113P63132 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC21.35■■□□□ 1.01
HERVK_113P63132 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
HERVK_113P63132 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.4 ms