Protein–RNA interactions for Protein: P62314

SNRPD1, Small nuclear ribonucleoprotein Sm D1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 119 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNRPD1P62314 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SNRPD1P62314 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SNRPD1P62314 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SNRPD1P62314 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
SNRPD1P62314 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
SNRPD1P62314 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
SNRPD1P62314 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
SNRPD1P62314 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SNRPD1P62314 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SNRPD1P62314 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SNRPD1P62314 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SNRPD1P62314 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SNRPD1P62314 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SNRPD1P62314 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SNRPD1P62314 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
SNRPD1P62314 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SNRPD1P62314 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SNRPD1P62314 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SNRPD1P62314 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SNRPD1P62314 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SNRPD1P62314 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SNRPD1P62314 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SNRPD1P62314 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SNRPD1P62314 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SNRPD1P62314 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SNRPD1P62314 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SNRPD1P62314 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SNRPD1P62314 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SNRPD1P62314 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SNRPD1P62314 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SNRPD1P62314 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SNRPD1P62314 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SNRPD1P62314 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SNRPD1P62314 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SNRPD1P62314 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SNRPD1P62314 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SNRPD1P62314 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SNRPD1P62314 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SNRPD1P62314 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SNRPD1P62314 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SNRPD1P62314 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SNRPD1P62314 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SNRPD1P62314 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
SNRPD1P62314 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SNRPD1P62314 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SNRPD1P62314 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SNRPD1P62314 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SNRPD1P62314 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SNRPD1P62314 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SNRPD1P62314 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SNRPD1P62314 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SNRPD1P62314 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SNRPD1P62314 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SNRPD1P62314 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
SNRPD1P62314 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
SNRPD1P62314 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
SNRPD1P62314 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SNRPD1P62314 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SNRPD1P62314 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SNRPD1P62314 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SNRPD1P62314 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SNRPD1P62314 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SNRPD1P62314 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SNRPD1P62314 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SNRPD1P62314 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SNRPD1P62314 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SNRPD1P62314 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SNRPD1P62314 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SNRPD1P62314 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SNRPD1P62314 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SNRPD1P62314 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SNRPD1P62314 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SNRPD1P62314 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SNRPD1P62314 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SNRPD1P62314 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
SNRPD1P62314 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SNRPD1P62314 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SNRPD1P62314 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SNRPD1P62314 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SNRPD1P62314 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SNRPD1P62314 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SNRPD1P62314 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SNRPD1P62314 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SNRPD1P62314 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SNRPD1P62314 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
SNRPD1P62314 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
SNRPD1P62314 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SNRPD1P62314 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SNRPD1P62314 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SNRPD1P62314 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SNRPD1P62314 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SNRPD1P62314 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SNRPD1P62314 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SNRPD1P62314 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SNRPD1P62314 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SNRPD1P62314 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SNRPD1P62314 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SNRPD1P62314 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SNRPD1P62314 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SNRPD1P62314 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.6 ms