Protein–RNA interactions for Protein: P61966

AP1S1, AP-1 complex subunit sigma-1A, humanhuman

Predictions only

Length 158 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AP1S1P61966 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
AP1S1P61966 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
AP1S1P61966 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
AP1S1P61966 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
AP1S1P61966 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
AP1S1P61966 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
AP1S1P61966 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
AP1S1P61966 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
AP1S1P61966 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
AP1S1P61966 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
AP1S1P61966 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
AP1S1P61966 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
AP1S1P61966 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
AP1S1P61966 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
AP1S1P61966 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
AP1S1P61966 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
AP1S1P61966 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
AP1S1P61966 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
AP1S1P61966 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
AP1S1P61966 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
AP1S1P61966 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
AP1S1P61966 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
AP1S1P61966 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
AP1S1P61966 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
AP1S1P61966 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
AP1S1P61966 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
AP1S1P61966 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
AP1S1P61966 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
AP1S1P61966 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
AP1S1P61966 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
AP1S1P61966 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
AP1S1P61966 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
AP1S1P61966 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
AP1S1P61966 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
AP1S1P61966 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
AP1S1P61966 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
AP1S1P61966 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
AP1S1P61966 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
AP1S1P61966 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
AP1S1P61966 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
AP1S1P61966 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
AP1S1P61966 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
AP1S1P61966 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
AP1S1P61966 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
AP1S1P61966 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
AP1S1P61966 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
AP1S1P61966 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
AP1S1P61966 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
AP1S1P61966 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
AP1S1P61966 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
AP1S1P61966 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
AP1S1P61966 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
AP1S1P61966 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
AP1S1P61966 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
AP1S1P61966 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
AP1S1P61966 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
AP1S1P61966 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
AP1S1P61966 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC22.05■■□□□ 1.12
AP1S1P61966 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
AP1S1P61966 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
AP1S1P61966 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
AP1S1P61966 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
AP1S1P61966 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
AP1S1P61966 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
AP1S1P61966 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
AP1S1P61966 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
AP1S1P61966 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
AP1S1P61966 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
AP1S1P61966 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
AP1S1P61966 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
AP1S1P61966 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
AP1S1P61966 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
AP1S1P61966 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
AP1S1P61966 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
AP1S1P61966 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
AP1S1P61966 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
AP1S1P61966 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
AP1S1P61966 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
AP1S1P61966 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
AP1S1P61966 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
AP1S1P61966 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
AP1S1P61966 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
AP1S1P61966 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
AP1S1P61966 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
AP1S1P61966 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
AP1S1P61966 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
AP1S1P61966 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
AP1S1P61966 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
AP1S1P61966 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
AP1S1P61966 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
AP1S1P61966 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
AP1S1P61966 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
AP1S1P61966 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
AP1S1P61966 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
AP1S1P61966 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
AP1S1P61966 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
AP1S1P61966 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
AP1S1P61966 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
AP1S1P61966 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC22.02■■□□□ 1.12
AP1S1P61966 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.2 ms