Protein–RNA interactions for Protein: P57772

EEFSEC, Selenocysteine-specific elongation factor, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 596 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EEFSECP57772 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
EEFSECP57772 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
EEFSECP57772 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
EEFSECP57772 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
EEFSECP57772 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
EEFSECP57772 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
EEFSECP57772 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
EEFSECP57772 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
EEFSECP57772 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
EEFSECP57772 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
EEFSECP57772 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
EEFSECP57772 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
EEFSECP57772 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
EEFSECP57772 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
EEFSECP57772 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
EEFSECP57772 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
EEFSECP57772 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
EEFSECP57772 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
EEFSECP57772 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
EEFSECP57772 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
EEFSECP57772 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
EEFSECP57772 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
EEFSECP57772 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
EEFSECP57772 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
EEFSECP57772 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
EEFSECP57772 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
EEFSECP57772 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
EEFSECP57772 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
EEFSECP57772 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
EEFSECP57772 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
EEFSECP57772 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
EEFSECP57772 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
EEFSECP57772 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
EEFSECP57772 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
EEFSECP57772 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
EEFSECP57772 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
EEFSECP57772 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
EEFSECP57772 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
EEFSECP57772 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
EEFSECP57772 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
EEFSECP57772 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
EEFSECP57772 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
EEFSECP57772 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
EEFSECP57772 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC20.84■□□□□ 0.93
EEFSECP57772 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
EEFSECP57772 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
EEFSECP57772 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
EEFSECP57772 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
EEFSECP57772 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC20.83■□□□□ 0.93
EEFSECP57772 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC20.83■□□□□ 0.93
EEFSECP57772 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC20.83■□□□□ 0.93
EEFSECP57772 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
EEFSECP57772 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
EEFSECP57772 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
EEFSECP57772 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.92
EEFSECP57772 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC20.83■□□□□ 0.92
EEFSECP57772 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
EEFSECP57772 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
EEFSECP57772 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
EEFSECP57772 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
EEFSECP57772 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
EEFSECP57772 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
EEFSECP57772 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
EEFSECP57772 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
EEFSECP57772 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
EEFSECP57772 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
EEFSECP57772 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
EEFSECP57772 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
EEFSECP57772 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
EEFSECP57772 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
EEFSECP57772 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
EEFSECP57772 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
EEFSECP57772 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC20.81■□□□□ 0.92
EEFSECP57772 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
EEFSECP57772 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
EEFSECP57772 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
EEFSECP57772 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.81■□□□□ 0.92
EEFSECP57772 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
EEFSECP57772 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
EEFSECP57772 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
EEFSECP57772 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
EEFSECP57772 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
EEFSECP57772 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
EEFSECP57772 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
EEFSECP57772 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
EEFSECP57772 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
EEFSECP57772 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
EEFSECP57772 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
EEFSECP57772 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
EEFSECP57772 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC20.8■□□□□ 0.92
EEFSECP57772 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
EEFSECP57772 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
EEFSECP57772 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
EEFSECP57772 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC20.8■□□□□ 0.92
EEFSECP57772 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC20.8■□□□□ 0.92
EEFSECP57772 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
EEFSECP57772 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
EEFSECP57772 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
EEFSECP57772 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
EEFSECP57772 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 96 ms