Protein–RNA interactions for Protein: P57768

SNX16, Sorting nexin-16, humanhuman

Predictions only

Length 344 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX16P57768 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SNX16P57768 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SNX16P57768 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SNX16P57768 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SNX16P57768 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SNX16P57768 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SNX16P57768 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SNX16P57768 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SNX16P57768 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SNX16P57768 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SNX16P57768 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SNX16P57768 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SNX16P57768 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SNX16P57768 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SNX16P57768 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SNX16P57768 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SNX16P57768 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SNX16P57768 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SNX16P57768 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SNX16P57768 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
SNX16P57768 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SNX16P57768 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SNX16P57768 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
SNX16P57768 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
SNX16P57768 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SNX16P57768 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SNX16P57768 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SNX16P57768 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SNX16P57768 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SNX16P57768 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SNX16P57768 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SNX16P57768 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SNX16P57768 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SNX16P57768 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SNX16P57768 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SNX16P57768 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SNX16P57768 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SNX16P57768 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SNX16P57768 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SNX16P57768 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SNX16P57768 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
SNX16P57768 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SNX16P57768 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SNX16P57768 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SNX16P57768 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SNX16P57768 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.08■■□□□ 1.29
SNX16P57768 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
SNX16P57768 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
SNX16P57768 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
SNX16P57768 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SNX16P57768 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
SNX16P57768 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
SNX16P57768 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
SNX16P57768 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SNX16P57768 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SNX16P57768 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SNX16P57768 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SNX16P57768 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
SNX16P57768 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SNX16P57768 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SNX16P57768 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SNX16P57768 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SNX16P57768 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SNX16P57768 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SNX16P57768 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SNX16P57768 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SNX16P57768 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SNX16P57768 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
SNX16P57768 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SNX16P57768 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
SNX16P57768 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SNX16P57768 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
SNX16P57768 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SNX16P57768 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SNX16P57768 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SNX16P57768 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SNX16P57768 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SNX16P57768 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SNX16P57768 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SNX16P57768 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
SNX16P57768 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SNX16P57768 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SNX16P57768 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
SNX16P57768 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SNX16P57768 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SNX16P57768 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SNX16P57768 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SNX16P57768 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SNX16P57768 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SNX16P57768 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SNX16P57768 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
SNX16P57768 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
SNX16P57768 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
SNX16P57768 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
SNX16P57768 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
SNX16P57768 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
SNX16P57768 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SNX16P57768 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SNX16P57768 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
SNX16P57768 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.3 ms