Protein–RNA interactions for Protein: P56693

SOX10, Transcription factor SOX-10, humanhuman

Predictions only

Length 466 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SOX10P56693 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
SOX10P56693 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
SOX10P56693 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
SOX10P56693 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
SOX10P56693 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
SOX10P56693 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
SOX10P56693 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
SOX10P56693 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
SOX10P56693 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
SOX10P56693 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
SOX10P56693 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
SOX10P56693 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
SOX10P56693 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
SOX10P56693 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
SOX10P56693 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
SOX10P56693 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
SOX10P56693 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
SOX10P56693 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
SOX10P56693 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
SOX10P56693 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
SOX10P56693 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
SOX10P56693 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
SOX10P56693 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
SOX10P56693 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
SOX10P56693 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
SOX10P56693 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
SOX10P56693 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
SOX10P56693 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
SOX10P56693 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
SOX10P56693 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
SOX10P56693 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
SOX10P56693 YKT6-207ENST00000496112 1270 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
SOX10P56693 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
SOX10P56693 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
SOX10P56693 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
SOX10P56693 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
SOX10P56693 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
SOX10P56693 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
SOX10P56693 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
SOX10P56693 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
SOX10P56693 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC25.29■■□□□ 1.64
SOX10P56693 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
SOX10P56693 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
SOX10P56693 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
SOX10P56693 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
SOX10P56693 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
SOX10P56693 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
SOX10P56693 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
SOX10P56693 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
SOX10P56693 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
SOX10P56693 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
SOX10P56693 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
SOX10P56693 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
SOX10P56693 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
SOX10P56693 RPS2P4-201ENST00000476944 856 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
SOX10P56693 MAX-217ENST00000557277 728 ntTSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
SOX10P56693 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
SOX10P56693 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
SOX10P56693 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
SOX10P56693 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
SOX10P56693 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
SOX10P56693 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
SOX10P56693 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
SOX10P56693 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
SOX10P56693 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
SOX10P56693 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
SOX10P56693 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC25.27■■□□□ 1.64
SOX10P56693 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
SOX10P56693 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
SOX10P56693 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
SOX10P56693 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
SOX10P56693 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
SOX10P56693 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
SOX10P56693 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
SOX10P56693 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
SOX10P56693 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
SOX10P56693 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
SOX10P56693 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
SOX10P56693 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
SOX10P56693 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
SOX10P56693 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
SOX10P56693 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
SOX10P56693 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
SOX10P56693 AC010331.1-201ENST00000611423 582 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
SOX10P56693 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
SOX10P56693 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
SOX10P56693 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
SOX10P56693 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
SOX10P56693 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
SOX10P56693 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
SOX10P56693 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
SOX10P56693 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
SOX10P56693 NDUFB2-203ENST00000461457 559 ntTSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
SOX10P56693 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
SOX10P56693 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
SOX10P56693 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
SOX10P56693 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
SOX10P56693 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
SOX10P56693 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
SOX10P56693 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.2 ms