Protein–RNA interactions for Protein: P55771

PAX9, Paired box protein Pax-9, humanhuman

Predictions only

Length 341 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PAX9P55771 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
PAX9P55771 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
PAX9P55771 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
PAX9P55771 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
PAX9P55771 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
PAX9P55771 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
PAX9P55771 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
PAX9P55771 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
PAX9P55771 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
PAX9P55771 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
PAX9P55771 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
PAX9P55771 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
PAX9P55771 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
PAX9P55771 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
PAX9P55771 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
PAX9P55771 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
PAX9P55771 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
PAX9P55771 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
PAX9P55771 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
PAX9P55771 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
PAX9P55771 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
PAX9P55771 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
PAX9P55771 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC17.57■□□□□ 0.4
PAX9P55771 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
PAX9P55771 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
PAX9P55771 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
PAX9P55771 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
PAX9P55771 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
PAX9P55771 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
PAX9P55771 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
PAX9P55771 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
PAX9P55771 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
PAX9P55771 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
PAX9P55771 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
PAX9P55771 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
PAX9P55771 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
PAX9P55771 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
PAX9P55771 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
PAX9P55771 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
PAX9P55771 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
PAX9P55771 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
PAX9P55771 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
PAX9P55771 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
PAX9P55771 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
PAX9P55771 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
PAX9P55771 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
PAX9P55771 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
PAX9P55771 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
PAX9P55771 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
PAX9P55771 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
PAX9P55771 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
PAX9P55771 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
PAX9P55771 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
PAX9P55771 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
PAX9P55771 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
PAX9P55771 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
PAX9P55771 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
PAX9P55771 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
PAX9P55771 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
PAX9P55771 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
PAX9P55771 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
PAX9P55771 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
PAX9P55771 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
PAX9P55771 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
PAX9P55771 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
PAX9P55771 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
PAX9P55771 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
PAX9P55771 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
PAX9P55771 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
PAX9P55771 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
PAX9P55771 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
PAX9P55771 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
PAX9P55771 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
PAX9P55771 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
PAX9P55771 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
PAX9P55771 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
PAX9P55771 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
PAX9P55771 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
PAX9P55771 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
PAX9P55771 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
PAX9P55771 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
PAX9P55771 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
PAX9P55771 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
PAX9P55771 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
PAX9P55771 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
PAX9P55771 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
PAX9P55771 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
PAX9P55771 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
PAX9P55771 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
PAX9P55771 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
PAX9P55771 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
PAX9P55771 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.53■□□□□ 0.4
PAX9P55771 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
PAX9P55771 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
PAX9P55771 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
PAX9P55771 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
PAX9P55771 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
PAX9P55771 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
PAX9P55771 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
PAX9P55771 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.2 ms