Protein–RNA interactions for Protein: P55735

SEC13, Protein SEC13 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 322 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEC13P55735 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SEC13P55735 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SEC13P55735 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
SEC13P55735 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SEC13P55735 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
SEC13P55735 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SEC13P55735 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SEC13P55735 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SEC13P55735 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SEC13P55735 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SEC13P55735 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
SEC13P55735 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
SEC13P55735 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SEC13P55735 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SEC13P55735 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SEC13P55735 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SEC13P55735 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SEC13P55735 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SEC13P55735 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
SEC13P55735 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SEC13P55735 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SEC13P55735 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SEC13P55735 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SEC13P55735 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SEC13P55735 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SEC13P55735 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
SEC13P55735 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SEC13P55735 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SEC13P55735 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SEC13P55735 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SEC13P55735 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SEC13P55735 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SEC13P55735 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SEC13P55735 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SEC13P55735 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SEC13P55735 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SEC13P55735 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SEC13P55735 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SEC13P55735 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SEC13P55735 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SEC13P55735 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SEC13P55735 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SEC13P55735 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SEC13P55735 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SEC13P55735 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SEC13P55735 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SEC13P55735 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SEC13P55735 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SEC13P55735 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SEC13P55735 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SEC13P55735 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SEC13P55735 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SEC13P55735 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SEC13P55735 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SEC13P55735 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SEC13P55735 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SEC13P55735 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SEC13P55735 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SEC13P55735 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SEC13P55735 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SEC13P55735 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SEC13P55735 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SEC13P55735 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SEC13P55735 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SEC13P55735 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SEC13P55735 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
SEC13P55735 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
SEC13P55735 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SEC13P55735 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SEC13P55735 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SEC13P55735 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SEC13P55735 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
SEC13P55735 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SEC13P55735 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SEC13P55735 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SEC13P55735 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SEC13P55735 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SEC13P55735 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SEC13P55735 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SEC13P55735 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SEC13P55735 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SEC13P55735 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SEC13P55735 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SEC13P55735 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SEC13P55735 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SEC13P55735 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SEC13P55735 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SEC13P55735 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SEC13P55735 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SEC13P55735 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SEC13P55735 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SEC13P55735 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SEC13P55735 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SEC13P55735 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SEC13P55735 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SEC13P55735 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SEC13P55735 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
SEC13P55735 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SEC13P55735 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SEC13P55735 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.3 ms