Protein–RNA interactions for Protein: P54845

NRL, Neural retina-specific leucine zipper protein, humanhuman

Predictions only

Length 237 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NRLP54845 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
NRLP54845 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
NRLP54845 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
NRLP54845 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
NRLP54845 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
NRLP54845 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
NRLP54845 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC23■■□□□ 1.27
NRLP54845 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
NRLP54845 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
NRLP54845 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
NRLP54845 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
NRLP54845 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
NRLP54845 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
NRLP54845 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
NRLP54845 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC22.99■■□□□ 1.27
NRLP54845 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
NRLP54845 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
NRLP54845 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
NRLP54845 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
NRLP54845 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
NRLP54845 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
NRLP54845 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
NRLP54845 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
NRLP54845 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC22.98■■□□□ 1.27
NRLP54845 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
NRLP54845 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
NRLP54845 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
NRLP54845 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
NRLP54845 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
NRLP54845 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
NRLP54845 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
NRLP54845 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
NRLP54845 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
NRLP54845 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
NRLP54845 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
NRLP54845 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
NRLP54845 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
NRLP54845 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
NRLP54845 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
NRLP54845 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
NRLP54845 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
NRLP54845 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
NRLP54845 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
NRLP54845 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
NRLP54845 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
NRLP54845 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
NRLP54845 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
NRLP54845 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
NRLP54845 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
NRLP54845 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
NRLP54845 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
NRLP54845 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
NRLP54845 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
NRLP54845 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
NRLP54845 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
NRLP54845 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC22.96■■□□□ 1.27
NRLP54845 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
NRLP54845 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
NRLP54845 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC22.95■■□□□ 1.26
NRLP54845 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
NRLP54845 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
NRLP54845 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
NRLP54845 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
NRLP54845 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
NRLP54845 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
NRLP54845 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
NRLP54845 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
NRLP54845 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
NRLP54845 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
NRLP54845 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
NRLP54845 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
NRLP54845 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
NRLP54845 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
NRLP54845 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
NRLP54845 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
NRLP54845 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
NRLP54845 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
NRLP54845 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
NRLP54845 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
NRLP54845 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
NRLP54845 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
NRLP54845 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
NRLP54845 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
NRLP54845 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
NRLP54845 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
NRLP54845 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
NRLP54845 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
NRLP54845 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC22.93■■□□□ 1.26
NRLP54845 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
NRLP54845 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
NRLP54845 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
NRLP54845 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
NRLP54845 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
NRLP54845 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
NRLP54845 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
NRLP54845 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC22.93■■□□□ 1.26
NRLP54845 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
NRLP54845 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
NRLP54845 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
NRLP54845 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 68.6 ms