Protein–RNA interactions for Protein: P54289

CACNA2D1, Voltage-dependent calcium channel subunit alpha-2/delta-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,103 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNA2D1P54289 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CACNA2D1P54289 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CACNA2D1P54289 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CACNA2D1P54289 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CACNA2D1P54289 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CACNA2D1P54289 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CACNA2D1P54289 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
CACNA2D1P54289 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CACNA2D1P54289 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
CACNA2D1P54289 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CACNA2D1P54289 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CACNA2D1P54289 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CACNA2D1P54289 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CACNA2D1P54289 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CACNA2D1P54289 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CACNA2D1P54289 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CACNA2D1P54289 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CACNA2D1P54289 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
CACNA2D1P54289 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CACNA2D1P54289 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CACNA2D1P54289 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CACNA2D1P54289 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CACNA2D1P54289 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CACNA2D1P54289 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CACNA2D1P54289 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
CACNA2D1P54289 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CACNA2D1P54289 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CACNA2D1P54289 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CACNA2D1P54289 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CACNA2D1P54289 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CACNA2D1P54289 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CACNA2D1P54289 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CACNA2D1P54289 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CACNA2D1P54289 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
CACNA2D1P54289 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CACNA2D1P54289 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CACNA2D1P54289 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CACNA2D1P54289 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CACNA2D1P54289 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CACNA2D1P54289 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CACNA2D1P54289 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CACNA2D1P54289 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CACNA2D1P54289 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CACNA2D1P54289 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CACNA2D1P54289 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CACNA2D1P54289 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CACNA2D1P54289 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CACNA2D1P54289 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CACNA2D1P54289 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CACNA2D1P54289 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CACNA2D1P54289 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CACNA2D1P54289 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CACNA2D1P54289 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CACNA2D1P54289 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CACNA2D1P54289 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CACNA2D1P54289 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CACNA2D1P54289 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CACNA2D1P54289 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CACNA2D1P54289 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CACNA2D1P54289 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CACNA2D1P54289 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CACNA2D1P54289 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CACNA2D1P54289 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CACNA2D1P54289 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CACNA2D1P54289 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CACNA2D1P54289 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CACNA2D1P54289 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CACNA2D1P54289 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CACNA2D1P54289 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CACNA2D1P54289 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CACNA2D1P54289 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CACNA2D1P54289 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CACNA2D1P54289 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CACNA2D1P54289 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CACNA2D1P54289 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CACNA2D1P54289 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CACNA2D1P54289 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CACNA2D1P54289 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CACNA2D1P54289 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CACNA2D1P54289 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CACNA2D1P54289 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
CACNA2D1P54289 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CACNA2D1P54289 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CACNA2D1P54289 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CACNA2D1P54289 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CACNA2D1P54289 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CACNA2D1P54289 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CACNA2D1P54289 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CACNA2D1P54289 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CACNA2D1P54289 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CACNA2D1P54289 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CACNA2D1P54289 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CACNA2D1P54289 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CACNA2D1P54289 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CACNA2D1P54289 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CACNA2D1P54289 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CACNA2D1P54289 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CACNA2D1P54289 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CACNA2D1P54289 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CACNA2D1P54289 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.8 ms