Protein–RNA interactions for Protein: P53814

SMTN, Smoothelin, humanhuman

Predictions only

Length 917 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMTNP53814 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SMTNP53814 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
SMTNP53814 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC24.23■■□□□ 1.47
SMTNP53814 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
SMTNP53814 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
SMTNP53814 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SMTNP53814 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC24.23■■□□□ 1.47
SMTNP53814 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SMTNP53814 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC24.22■■□□□ 1.47
SMTNP53814 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
SMTNP53814 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
SMTNP53814 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
SMTNP53814 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
SMTNP53814 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
SMTNP53814 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
SMTNP53814 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SMTNP53814 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
SMTNP53814 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
SMTNP53814 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC24.22■■□□□ 1.47
SMTNP53814 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
SMTNP53814 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
SMTNP53814 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
SMTNP53814 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SMTNP53814 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SMTNP53814 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
SMTNP53814 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
SMTNP53814 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SMTNP53814 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SMTNP53814 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
SMTNP53814 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
SMTNP53814 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
SMTNP53814 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SMTNP53814 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SMTNP53814 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
SMTNP53814 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SMTNP53814 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
SMTNP53814 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
SMTNP53814 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
SMTNP53814 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
SMTNP53814 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
SMTNP53814 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC24.2■■□□□ 1.46
SMTNP53814 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
SMTNP53814 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
SMTNP53814 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
SMTNP53814 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
SMTNP53814 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
SMTNP53814 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
SMTNP53814 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
SMTNP53814 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
SMTNP53814 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
SMTNP53814 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
SMTNP53814 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SMTNP53814 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
SMTNP53814 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SMTNP53814 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SMTNP53814 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
SMTNP53814 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC24.19■■□□□ 1.46
SMTNP53814 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC24.19■■□□□ 1.46
SMTNP53814 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
SMTNP53814 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
SMTNP53814 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
SMTNP53814 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SMTNP53814 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
SMTNP53814 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SMTNP53814 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SMTNP53814 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
SMTNP53814 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
SMTNP53814 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
SMTNP53814 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
SMTNP53814 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SMTNP53814 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
SMTNP53814 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
SMTNP53814 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SMTNP53814 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SMTNP53814 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC24.18■■□□□ 1.46
SMTNP53814 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
SMTNP53814 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC24.17■■□□□ 1.46
SMTNP53814 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SMTNP53814 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SMTNP53814 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
SMTNP53814 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
SMTNP53814 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
SMTNP53814 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SMTNP53814 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SMTNP53814 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SMTNP53814 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
SMTNP53814 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SMTNP53814 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SMTNP53814 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
SMTNP53814 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
SMTNP53814 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
SMTNP53814 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SMTNP53814 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SMTNP53814 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SMTNP53814 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
SMTNP53814 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SMTNP53814 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC24.15■■□□□ 1.46
SMTNP53814 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SMTNP53814 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
SMTNP53814 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.6 ms