Protein–RNA interactions for Protein: P53680

AP2S1, AP-2 complex subunit sigma, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 142 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AP2S1P53680 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
AP2S1P53680 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
AP2S1P53680 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
AP2S1P53680 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC18.52■□□□□ 0.56
AP2S1P53680 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
AP2S1P53680 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
AP2S1P53680 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
AP2S1P53680 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
AP2S1P53680 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
AP2S1P53680 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.55
AP2S1P53680 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
AP2S1P53680 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
AP2S1P53680 SMPD1-201ENST00000342245 2452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
AP2S1P53680 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
AP2S1P53680 POU3F2-201ENST00000328345 4879 ntAPPRIS P1 BASIC18.51■□□□□ 0.55
AP2S1P53680 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
AP2S1P53680 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
AP2S1P53680 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
AP2S1P53680 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
AP2S1P53680 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
AP2S1P53680 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
AP2S1P53680 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
AP2S1P53680 MYH14-208ENST00000598205 6137 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
AP2S1P53680 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC18.51■□□□□ 0.55
AP2S1P53680 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
AP2S1P53680 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
AP2S1P53680 ADAMTS19-201ENST00000274487 5234 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
AP2S1P53680 ECEL1-201ENST00000304546 2865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
AP2S1P53680 IGLON5-201ENST00000270642 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
AP2S1P53680 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
AP2S1P53680 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
AP2S1P53680 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
AP2S1P53680 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
AP2S1P53680 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
AP2S1P53680 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
AP2S1P53680 OLFM1-205ENST00000371796 2492 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
AP2S1P53680 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
AP2S1P53680 UBE2N-201ENST00000318066 5186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
AP2S1P53680 GRB10-201ENST00000335866 5032 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
AP2S1P53680 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
AP2S1P53680 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
AP2S1P53680 PTGER2-201ENST00000245457 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
AP2S1P53680 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
AP2S1P53680 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
AP2S1P53680 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
AP2S1P53680 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
AP2S1P53680 XKR6-203ENST00000416569 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
AP2S1P53680 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
AP2S1P53680 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
AP2S1P53680 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
AP2S1P53680 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
AP2S1P53680 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
AP2S1P53680 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
AP2S1P53680 LARGE2-202ENST00000401752 2516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
AP2S1P53680 ADAMTS19-205ENST00000638972 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
AP2S1P53680 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
AP2S1P53680 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
AP2S1P53680 TMTC1-203ENST00000539277 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
AP2S1P53680 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
AP2S1P53680 SPAST-203ENST00000615843 5212 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
AP2S1P53680 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
AP2S1P53680 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
AP2S1P53680 LIN54-209ENST00000510557 2257 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
AP2S1P53680 KMT5B-201ENST00000304363 5837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
AP2S1P53680 ZNRF1-202ENST00000335325 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
AP2S1P53680 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
AP2S1P53680 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
AP2S1P53680 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
AP2S1P53680 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
AP2S1P53680 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
AP2S1P53680 MAPK9-208ENST00000455781 4336 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
AP2S1P53680 KIF26A-202ENST00000423312 5649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
AP2S1P53680 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
AP2S1P53680 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
AP2S1P53680 ANKS1A-201ENST00000360359 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
AP2S1P53680 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
AP2S1P53680 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
AP2S1P53680 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
AP2S1P53680 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
AP2S1P53680 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
AP2S1P53680 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
AP2S1P53680 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
AP2S1P53680 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
AP2S1P53680 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
AP2S1P53680 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
AP2S1P53680 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
AP2S1P53680 EIF4E3-201ENST00000295612 2764 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
AP2S1P53680 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
AP2S1P53680 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
AP2S1P53680 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
AP2S1P53680 TBC1D4-201ENST00000377625 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
AP2S1P53680 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
AP2S1P53680 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
AP2S1P53680 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
AP2S1P53680 KANSL1-218ENST00000638275 5352 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
AP2S1P53680 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
AP2S1P53680 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
AP2S1P53680 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
AP2S1P53680 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
AP2S1P53680 TRABD-201ENST00000303434 2329 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.2 ms