Protein–RNA interactions for Protein: P53621

COPA, Coatomer subunit alpha, humanhuman

Predictions only

Length 1,224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COPAP53621 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
COPAP53621 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
COPAP53621 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
COPAP53621 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
COPAP53621 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
COPAP53621 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
COPAP53621 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
COPAP53621 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
COPAP53621 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
COPAP53621 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
COPAP53621 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
COPAP53621 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
COPAP53621 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
COPAP53621 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
COPAP53621 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
COPAP53621 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
COPAP53621 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
COPAP53621 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
COPAP53621 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
COPAP53621 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
COPAP53621 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
COPAP53621 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
COPAP53621 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
COPAP53621 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
COPAP53621 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
COPAP53621 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
COPAP53621 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
COPAP53621 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
COPAP53621 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
COPAP53621 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
COPAP53621 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
COPAP53621 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
COPAP53621 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
COPAP53621 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
COPAP53621 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
COPAP53621 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
COPAP53621 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
COPAP53621 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
COPAP53621 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
COPAP53621 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
COPAP53621 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
COPAP53621 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
COPAP53621 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
COPAP53621 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
COPAP53621 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
COPAP53621 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
COPAP53621 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
COPAP53621 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
COPAP53621 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
COPAP53621 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
COPAP53621 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
COPAP53621 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
COPAP53621 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
COPAP53621 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
COPAP53621 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
COPAP53621 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
COPAP53621 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
COPAP53621 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
COPAP53621 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
COPAP53621 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
COPAP53621 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
COPAP53621 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
COPAP53621 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
COPAP53621 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
COPAP53621 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
COPAP53621 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
COPAP53621 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
COPAP53621 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
COPAP53621 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
COPAP53621 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
COPAP53621 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
COPAP53621 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
COPAP53621 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
COPAP53621 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
COPAP53621 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
COPAP53621 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
COPAP53621 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
COPAP53621 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
COPAP53621 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
COPAP53621 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
COPAP53621 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
COPAP53621 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
COPAP53621 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
COPAP53621 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
COPAP53621 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
COPAP53621 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
COPAP53621 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
COPAP53621 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.19
COPAP53621 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
COPAP53621 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
COPAP53621 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
COPAP53621 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
COPAP53621 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
COPAP53621 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
COPAP53621 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
COPAP53621 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
COPAP53621 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
COPAP53621 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
COPAP53621 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC22.44■■□□□ 1.18
COPAP53621 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.4 ms