Protein–RNA interactions for Protein: P52948

NUP98, Nuclear pore complex protein Nup98-Nup96, humanhuman

Predictions only

Length 1,817 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUP98P52948 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC27.69■■■□□ 2.02
NUP98P52948 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
NUP98P52948 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC27.68■■■□□ 2.02
NUP98P52948 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
NUP98P52948 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
NUP98P52948 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
NUP98P52948 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
NUP98P52948 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
NUP98P52948 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
NUP98P52948 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
NUP98P52948 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
NUP98P52948 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
NUP98P52948 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
NUP98P52948 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
NUP98P52948 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.67■■■□□ 2.02
NUP98P52948 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
NUP98P52948 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
NUP98P52948 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
NUP98P52948 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
NUP98P52948 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
NUP98P52948 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
NUP98P52948 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
NUP98P52948 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
NUP98P52948 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
NUP98P52948 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
NUP98P52948 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
NUP98P52948 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
NUP98P52948 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
NUP98P52948 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
NUP98P52948 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
NUP98P52948 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
NUP98P52948 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.02
NUP98P52948 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC27.64■■■□□ 2.02
NUP98P52948 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
NUP98P52948 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.02
NUP98P52948 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.02
NUP98P52948 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.02
NUP98P52948 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.01
NUP98P52948 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.63■■■□□ 2.01
NUP98P52948 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
NUP98P52948 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
NUP98P52948 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
NUP98P52948 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
NUP98P52948 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
NUP98P52948 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
NUP98P52948 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
NUP98P52948 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC27.62■■■□□ 2.01
NUP98P52948 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC27.62■■■□□ 2.01
NUP98P52948 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC27.62■■■□□ 2.01
NUP98P52948 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
NUP98P52948 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
NUP98P52948 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
NUP98P52948 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
NUP98P52948 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
NUP98P52948 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
NUP98P52948 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
NUP98P52948 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
NUP98P52948 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC27.61■■■□□ 2.01
NUP98P52948 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
NUP98P52948 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
NUP98P52948 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
NUP98P52948 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC27.6■■■□□ 2.01
NUP98P52948 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
NUP98P52948 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
NUP98P52948 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
NUP98P52948 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
NUP98P52948 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
NUP98P52948 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
NUP98P52948 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC27.6■■■□□ 2.01
NUP98P52948 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
NUP98P52948 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
NUP98P52948 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
NUP98P52948 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC27.59■■■□□ 2.01
NUP98P52948 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
NUP98P52948 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
NUP98P52948 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC27.59■■■□□ 2.01
NUP98P52948 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
NUP98P52948 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
NUP98P52948 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
NUP98P52948 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
NUP98P52948 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.59■■■□□ 2.01
NUP98P52948 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
NUP98P52948 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
NUP98P52948 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
NUP98P52948 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
NUP98P52948 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
NUP98P52948 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC27.58■■■□□ 2.01
NUP98P52948 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
NUP98P52948 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC27.58■■■□□ 2.01
NUP98P52948 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
NUP98P52948 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
NUP98P52948 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC27.57■■■□□ 2
NUP98P52948 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC27.57■■■□□ 2
NUP98P52948 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
NUP98P52948 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
NUP98P52948 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC27.57■■■□□ 2
NUP98P52948 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC27.57■■■□□ 2
NUP98P52948 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
NUP98P52948 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
NUP98P52948 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.5 ms