Protein–RNA interactions for Protein: P52907

CAPZA1, F-actin-capping protein subunit alpha-1, humanhuman

Predictions only

Length 286 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPZA1P52907 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
CAPZA1P52907 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
CAPZA1P52907 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
CAPZA1P52907 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
CAPZA1P52907 HDAC4-215ENST00000543185 8990 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CAPZA1P52907 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CAPZA1P52907 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CAPZA1P52907 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CAPZA1P52907 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CAPZA1P52907 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CAPZA1P52907 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CAPZA1P52907 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CAPZA1P52907 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CAPZA1P52907 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CAPZA1P52907 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CAPZA1P52907 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CAPZA1P52907 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CAPZA1P52907 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CAPZA1P52907 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CAPZA1P52907 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CAPZA1P52907 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CAPZA1P52907 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CAPZA1P52907 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CAPZA1P52907 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CAPZA1P52907 ADGRA2-201ENST00000315215 6270 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CAPZA1P52907 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CAPZA1P52907 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CAPZA1P52907 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CAPZA1P52907 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CAPZA1P52907 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CAPZA1P52907 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CAPZA1P52907 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CAPZA1P52907 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CAPZA1P52907 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CAPZA1P52907 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CAPZA1P52907 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CAPZA1P52907 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CAPZA1P52907 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CAPZA1P52907 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CAPZA1P52907 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CAPZA1P52907 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CAPZA1P52907 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CAPZA1P52907 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CAPZA1P52907 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CAPZA1P52907 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CAPZA1P52907 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CAPZA1P52907 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CAPZA1P52907 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
CAPZA1P52907 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CAPZA1P52907 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
CAPZA1P52907 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
CAPZA1P52907 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
CAPZA1P52907 KMT5B-201ENST00000304363 5837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
CAPZA1P52907 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CAPZA1P52907 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CAPZA1P52907 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CAPZA1P52907 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
CAPZA1P52907 FLT1-209ENST00000639477 6337 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
CAPZA1P52907 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CAPZA1P52907 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CAPZA1P52907 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CAPZA1P52907 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
CAPZA1P52907 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
CAPZA1P52907 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
CAPZA1P52907 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
CAPZA1P52907 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CAPZA1P52907 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CAPZA1P52907 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CAPZA1P52907 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CAPZA1P52907 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
CAPZA1P52907 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
CAPZA1P52907 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC19.04■□□□□ 0.64
CAPZA1P52907 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
CAPZA1P52907 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CAPZA1P52907 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CAPZA1P52907 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
CAPZA1P52907 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CAPZA1P52907 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CAPZA1P52907 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
CAPZA1P52907 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CAPZA1P52907 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CAPZA1P52907 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CAPZA1P52907 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
CAPZA1P52907 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
CAPZA1P52907 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CAPZA1P52907 LGI2-201ENST00000382114 6428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CAPZA1P52907 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
CAPZA1P52907 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
CAPZA1P52907 ARID4B-203ENST00000366603 5946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CAPZA1P52907 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CAPZA1P52907 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
CAPZA1P52907 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CAPZA1P52907 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CAPZA1P52907 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
CAPZA1P52907 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
CAPZA1P52907 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
CAPZA1P52907 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
CAPZA1P52907 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
CAPZA1P52907 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
CAPZA1P52907 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.1 ms