Protein–RNA interactions for Protein: P51790

CLCN3, H(+)/Cl(-) exchange transporter 3, humanhuman

Predictions only

Length 818 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLCN3P51790 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CLCN3P51790 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CLCN3P51790 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CLCN3P51790 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
CLCN3P51790 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CLCN3P51790 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
CLCN3P51790 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CLCN3P51790 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CLCN3P51790 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
CLCN3P51790 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
CLCN3P51790 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CLCN3P51790 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
CLCN3P51790 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CLCN3P51790 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CLCN3P51790 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CLCN3P51790 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CLCN3P51790 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CLCN3P51790 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CLCN3P51790 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CLCN3P51790 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CLCN3P51790 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CLCN3P51790 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CLCN3P51790 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CLCN3P51790 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CLCN3P51790 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CLCN3P51790 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CLCN3P51790 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CLCN3P51790 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CLCN3P51790 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CLCN3P51790 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CLCN3P51790 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CLCN3P51790 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CLCN3P51790 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CLCN3P51790 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CLCN3P51790 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CLCN3P51790 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CLCN3P51790 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CLCN3P51790 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CLCN3P51790 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CLCN3P51790 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CLCN3P51790 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CLCN3P51790 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CLCN3P51790 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CLCN3P51790 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CLCN3P51790 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CLCN3P51790 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CLCN3P51790 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CLCN3P51790 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CLCN3P51790 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CLCN3P51790 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CLCN3P51790 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CLCN3P51790 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CLCN3P51790 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CLCN3P51790 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CLCN3P51790 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CLCN3P51790 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CLCN3P51790 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CLCN3P51790 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
CLCN3P51790 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
CLCN3P51790 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CLCN3P51790 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CLCN3P51790 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CLCN3P51790 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CLCN3P51790 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CLCN3P51790 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CLCN3P51790 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CLCN3P51790 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CLCN3P51790 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
CLCN3P51790 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
CLCN3P51790 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CLCN3P51790 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CLCN3P51790 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CLCN3P51790 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CLCN3P51790 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
CLCN3P51790 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
CLCN3P51790 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
CLCN3P51790 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
CLCN3P51790 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
CLCN3P51790 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.46
CLCN3P51790 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
CLCN3P51790 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
CLCN3P51790 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
CLCN3P51790 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
CLCN3P51790 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
CLCN3P51790 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
CLCN3P51790 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
CLCN3P51790 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
CLCN3P51790 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
CLCN3P51790 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CLCN3P51790 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CLCN3P51790 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CLCN3P51790 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CLCN3P51790 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CLCN3P51790 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CLCN3P51790 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CLCN3P51790 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CLCN3P51790 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CLCN3P51790 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CLCN3P51790 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CLCN3P51790 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.7 ms