Protein–RNA interactions for Protein: P51668

UBE2D1, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 D1, humanhuman

Predictions only

Length 147 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE2D1P51668 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
UBE2D1P51668 ADAMTS10-205ENST00000595838 2458 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
UBE2D1P51668 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
UBE2D1P51668 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
UBE2D1P51668 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
UBE2D1P51668 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
UBE2D1P51668 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
UBE2D1P51668 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
UBE2D1P51668 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
UBE2D1P51668 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
UBE2D1P51668 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
UBE2D1P51668 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
UBE2D1P51668 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
UBE2D1P51668 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
UBE2D1P51668 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
UBE2D1P51668 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
UBE2D1P51668 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
UBE2D1P51668 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
UBE2D1P51668 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
UBE2D1P51668 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
UBE2D1P51668 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
UBE2D1P51668 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
UBE2D1P51668 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.02
UBE2D1P51668 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
UBE2D1P51668 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
UBE2D1P51668 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
UBE2D1P51668 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
UBE2D1P51668 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
UBE2D1P51668 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
UBE2D1P51668 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
UBE2D1P51668 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
UBE2D1P51668 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
UBE2D1P51668 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
UBE2D1P51668 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
UBE2D1P51668 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
UBE2D1P51668 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
UBE2D1P51668 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
UBE2D1P51668 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
UBE2D1P51668 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
UBE2D1P51668 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
UBE2D1P51668 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
UBE2D1P51668 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
UBE2D1P51668 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
UBE2D1P51668 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
UBE2D1P51668 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
UBE2D1P51668 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
UBE2D1P51668 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
UBE2D1P51668 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
UBE2D1P51668 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
UBE2D1P51668 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
UBE2D1P51668 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
UBE2D1P51668 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
UBE2D1P51668 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
UBE2D1P51668 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
UBE2D1P51668 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
UBE2D1P51668 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
UBE2D1P51668 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
UBE2D1P51668 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
UBE2D1P51668 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
UBE2D1P51668 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
UBE2D1P51668 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
UBE2D1P51668 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
UBE2D1P51668 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
UBE2D1P51668 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
UBE2D1P51668 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
UBE2D1P51668 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
UBE2D1P51668 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
UBE2D1P51668 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
UBE2D1P51668 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
UBE2D1P51668 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
UBE2D1P51668 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
UBE2D1P51668 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
UBE2D1P51668 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
UBE2D1P51668 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
UBE2D1P51668 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
UBE2D1P51668 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
UBE2D1P51668 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
UBE2D1P51668 GTPBP3-222ENST00000600625 2493 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
UBE2D1P51668 CRTC1-203ENST00000594658 2384 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
UBE2D1P51668 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
UBE2D1P51668 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
UBE2D1P51668 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
UBE2D1P51668 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
UBE2D1P51668 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
UBE2D1P51668 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
UBE2D1P51668 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
UBE2D1P51668 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
UBE2D1P51668 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
UBE2D1P51668 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
UBE2D1P51668 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
UBE2D1P51668 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
UBE2D1P51668 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
UBE2D1P51668 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
UBE2D1P51668 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
UBE2D1P51668 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
UBE2D1P51668 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
UBE2D1P51668 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
UBE2D1P51668 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
UBE2D1P51668 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
UBE2D1P51668 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64 ms