Protein–RNA interactions for Protein: P50993

ATP1A2, Sodium/potassium-transporting ATPase subunit alpha-2, humanhuman

Predictions only

Length 1,020 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP1A2P50993 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
ATP1A2P50993 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC22.68■■□□□ 1.22
ATP1A2P50993 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
ATP1A2P50993 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
ATP1A2P50993 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ATP1A2P50993 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
ATP1A2P50993 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ATP1A2P50993 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
ATP1A2P50993 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
ATP1A2P50993 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ATP1A2P50993 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
ATP1A2P50993 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ATP1A2P50993 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
ATP1A2P50993 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ATP1A2P50993 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
ATP1A2P50993 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
ATP1A2P50993 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
ATP1A2P50993 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ATP1A2P50993 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ATP1A2P50993 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
ATP1A2P50993 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
ATP1A2P50993 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ATP1A2P50993 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
ATP1A2P50993 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
ATP1A2P50993 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ATP1A2P50993 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
ATP1A2P50993 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ATP1A2P50993 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ATP1A2P50993 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ATP1A2P50993 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
ATP1A2P50993 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ATP1A2P50993 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ATP1A2P50993 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ATP1A2P50993 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
ATP1A2P50993 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ATP1A2P50993 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ATP1A2P50993 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
ATP1A2P50993 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ATP1A2P50993 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ATP1A2P50993 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ATP1A2P50993 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ATP1A2P50993 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ATP1A2P50993 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ATP1A2P50993 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
ATP1A2P50993 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ATP1A2P50993 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
ATP1A2P50993 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ATP1A2P50993 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
ATP1A2P50993 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
ATP1A2P50993 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ATP1A2P50993 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
ATP1A2P50993 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
ATP1A2P50993 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
ATP1A2P50993 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ATP1A2P50993 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
ATP1A2P50993 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
ATP1A2P50993 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
ATP1A2P50993 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
ATP1A2P50993 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
ATP1A2P50993 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
ATP1A2P50993 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
ATP1A2P50993 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
ATP1A2P50993 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
ATP1A2P50993 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
ATP1A2P50993 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
ATP1A2P50993 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
ATP1A2P50993 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
ATP1A2P50993 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
ATP1A2P50993 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ATP1A2P50993 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
ATP1A2P50993 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ATP1A2P50993 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ATP1A2P50993 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ATP1A2P50993 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
ATP1A2P50993 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ATP1A2P50993 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
ATP1A2P50993 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
ATP1A2P50993 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC22.62■■□□□ 1.21
ATP1A2P50993 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ATP1A2P50993 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ATP1A2P50993 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ATP1A2P50993 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ATP1A2P50993 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ATP1A2P50993 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC22.62■■□□□ 1.21
ATP1A2P50993 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
ATP1A2P50993 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC22.62■■□□□ 1.21
ATP1A2P50993 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
ATP1A2P50993 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ATP1A2P50993 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
ATP1A2P50993 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
ATP1A2P50993 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
ATP1A2P50993 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
ATP1A2P50993 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
ATP1A2P50993 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
ATP1A2P50993 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
ATP1A2P50993 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
ATP1A2P50993 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
ATP1A2P50993 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
ATP1A2P50993 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
ATP1A2P50993 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.9 ms